Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm6685D3YYP3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm6685D3YYP3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm6685D3YYP3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm6685D3YYP3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm6685D3YYP3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm6685D3YYP3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm6685D3YYP3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm6685D3YYP3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm6685D3YYP3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm6685D3YYP3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm6685D3YYP3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm6685D3YYP3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm6685D3YYP3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm6685D3YYP3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm6685D3YYP3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm6685D3YYP3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm6685D3YYP3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm6685D3YYP3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm6685D3YYP3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm6685D3YYP3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm6685D3YYP3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm6685D3YYP3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm6685D3YYP3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm6685D3YYP3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm6685D3YYP3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm6685D3YYP3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm6685D3YYP3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm6685D3YYP3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm6685D3YYP3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm6685D3YYP3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm6685D3YYP3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm6685D3YYP3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm6685D3YYP3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm6685D3YYP3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm6685D3YYP3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm6685D3YYP3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm6685D3YYP3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm6685D3YYP3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm6685D3YYP3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm6685D3YYP3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm6685D3YYP3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm6685D3YYP3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm6685D3YYP3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm6685D3YYP3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm6685D3YYP3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm6685D3YYP3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm6685D3YYP3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm6685D3YYP3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm6685D3YYP3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm6685D3YYP3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm6685D3YYP3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm6685D3YYP3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm6685D3YYP3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm6685D3YYP3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm6685D3YYP3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm6685D3YYP3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm6685D3YYP3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm6685D3YYP3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm6685D3YYP3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm6685D3YYP3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm6685D3YYP3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm6685D3YYP3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm6685D3YYP3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm6685D3YYP3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm6685D3YYP3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm6685D3YYP3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm6685D3YYP3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm6685D3YYP3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm6685D3YYP3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm6685D3YYP3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm6685D3YYP3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm6685D3YYP3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm6685D3YYP3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm6685D3YYP3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm6685D3YYP3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm6685D3YYP3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm6685D3YYP3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm6685D3YYP3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm6685D3YYP3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm6685D3YYP3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm6685D3YYP3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm6685D3YYP3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm6685D3YYP3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm6685D3YYP3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm6685D3YYP3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm6685D3YYP3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm6685D3YYP3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm6685D3YYP3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm6685D3YYP3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm6685D3YYP3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm6685D3YYP3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm6685D3YYP3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm6685D3YYP3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm6685D3YYP3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm6685D3YYP3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm6685D3YYP3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm6685D3YYP3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm6685D3YYP3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm6685D3YYP3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms