Protein–RNA interactions for Protein: D3YY23

Lonrf1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 762 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf1D3YY23 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lonrf1D3YY23 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lonrf1D3YY23 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lonrf1D3YY23 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lonrf1D3YY23 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lonrf1D3YY23 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lonrf1D3YY23 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lonrf1D3YY23 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Lonrf1D3YY23 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lonrf1D3YY23 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lonrf1D3YY23 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lonrf1D3YY23 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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