Protein–RNA interactions for Protein: D3YUR1

4930444P10Rik, RIKEN cDNA 4930444P10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444P10RikD3YUR1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930444P10RikD3YUR1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930444P10RikD3YUR1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930444P10RikD3YUR1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930444P10RikD3YUR1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930444P10RikD3YUR1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930444P10RikD3YUR1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930444P10RikD3YUR1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930444P10RikD3YUR1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930444P10RikD3YUR1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930444P10RikD3YUR1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930444P10RikD3YUR1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930444P10RikD3YUR1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930444P10RikD3YUR1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930444P10RikD3YUR1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930444P10RikD3YUR1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930444P10RikD3YUR1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930444P10RikD3YUR1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930444P10RikD3YUR1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930444P10RikD3YUR1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930444P10RikD3YUR1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930444P10RikD3YUR1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930444P10RikD3YUR1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930444P10RikD3YUR1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930444P10RikD3YUR1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930444P10RikD3YUR1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930444P10RikD3YUR1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930444P10RikD3YUR1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930444P10RikD3YUR1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930444P10RikD3YUR1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930444P10RikD3YUR1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930444P10RikD3YUR1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930444P10RikD3YUR1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930444P10RikD3YUR1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930444P10RikD3YUR1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930444P10RikD3YUR1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930444P10RikD3YUR1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930444P10RikD3YUR1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930444P10RikD3YUR1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930444P10RikD3YUR1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930444P10RikD3YUR1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930444P10RikD3YUR1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930444P10RikD3YUR1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930444P10RikD3YUR1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930444P10RikD3YUR1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930444P10RikD3YUR1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930444P10RikD3YUR1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930444P10RikD3YUR1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930444P10RikD3YUR1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930444P10RikD3YUR1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930444P10RikD3YUR1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930444P10RikD3YUR1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930444P10RikD3YUR1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930444P10RikD3YUR1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
4930444P10RikD3YUR1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930444P10RikD3YUR1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930444P10RikD3YUR1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930444P10RikD3YUR1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930444P10RikD3YUR1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930444P10RikD3YUR1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930444P10RikD3YUR1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930444P10RikD3YUR1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
4930444P10RikD3YUR1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
4930444P10RikD3YUR1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930444P10RikD3YUR1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930444P10RikD3YUR1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930444P10RikD3YUR1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930444P10RikD3YUR1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930444P10RikD3YUR1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930444P10RikD3YUR1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930444P10RikD3YUR1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930444P10RikD3YUR1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930444P10RikD3YUR1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930444P10RikD3YUR1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930444P10RikD3YUR1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930444P10RikD3YUR1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930444P10RikD3YUR1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
4930444P10RikD3YUR1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930444P10RikD3YUR1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930444P10RikD3YUR1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
4930444P10RikD3YUR1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930444P10RikD3YUR1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930444P10RikD3YUR1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930444P10RikD3YUR1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930444P10RikD3YUR1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930444P10RikD3YUR1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
4930444P10RikD3YUR1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930444P10RikD3YUR1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930444P10RikD3YUR1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930444P10RikD3YUR1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930444P10RikD3YUR1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930444P10RikD3YUR1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930444P10RikD3YUR1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930444P10RikD3YUR1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930444P10RikD3YUR1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930444P10RikD3YUR1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930444P10RikD3YUR1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
4930444P10RikD3YUR1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930444P10RikD3YUR1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930444P10RikD3YUR1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.1 ms