Protein–RNA interactions for Protein: C6KI89

Catsperg2, Cation channel sperm-associated protein subunit gamma 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsperg2C6KI89 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Catsperg2C6KI89 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Catsperg2C6KI89 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Catsperg2C6KI89 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Catsperg2C6KI89 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Catsperg2C6KI89 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Catsperg2C6KI89 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Catsperg2C6KI89 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Catsperg2C6KI89 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Catsperg2C6KI89 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Catsperg2C6KI89 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Catsperg2C6KI89 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Catsperg2C6KI89 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Catsperg2C6KI89 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Catsperg2C6KI89 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Catsperg2C6KI89 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Catsperg2C6KI89 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Catsperg2C6KI89 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Catsperg2C6KI89 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Catsperg2C6KI89 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Catsperg2C6KI89 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Catsperg2C6KI89 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Catsperg2C6KI89 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Catsperg2C6KI89 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Catsperg2C6KI89 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Catsperg2C6KI89 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Catsperg2C6KI89 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Catsperg2C6KI89 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Catsperg2C6KI89 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Catsperg2C6KI89 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Catsperg2C6KI89 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Catsperg2C6KI89 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Catsperg2C6KI89 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Catsperg2C6KI89 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Catsperg2C6KI89 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Catsperg2C6KI89 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Catsperg2C6KI89 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Catsperg2C6KI89 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Catsperg2C6KI89 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Catsperg2C6KI89 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Catsperg2C6KI89 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Catsperg2C6KI89 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Catsperg2C6KI89 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Catsperg2C6KI89 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Catsperg2C6KI89 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Catsperg2C6KI89 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Catsperg2C6KI89 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Catsperg2C6KI89 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Catsperg2C6KI89 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Catsperg2C6KI89 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Catsperg2C6KI89 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Catsperg2C6KI89 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Catsperg2C6KI89 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Catsperg2C6KI89 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Catsperg2C6KI89 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Catsperg2C6KI89 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Catsperg2C6KI89 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Catsperg2C6KI89 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Catsperg2C6KI89 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Catsperg2C6KI89 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Catsperg2C6KI89 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Catsperg2C6KI89 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Catsperg2C6KI89 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Catsperg2C6KI89 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Catsperg2C6KI89 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Catsperg2C6KI89 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Catsperg2C6KI89 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Catsperg2C6KI89 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Catsperg2C6KI89 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Catsperg2C6KI89 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Catsperg2C6KI89 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Catsperg2C6KI89 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Catsperg2C6KI89 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Catsperg2C6KI89 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Catsperg2C6KI89 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Catsperg2C6KI89 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Catsperg2C6KI89 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Catsperg2C6KI89 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Catsperg2C6KI89 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Catsperg2C6KI89 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Catsperg2C6KI89 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Catsperg2C6KI89 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Catsperg2C6KI89 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Catsperg2C6KI89 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Catsperg2C6KI89 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Catsperg2C6KI89 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Catsperg2C6KI89 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Catsperg2C6KI89 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Catsperg2C6KI89 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Catsperg2C6KI89 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Catsperg2C6KI89 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Catsperg2C6KI89 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Catsperg2C6KI89 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Catsperg2C6KI89 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Catsperg2C6KI89 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Catsperg2C6KI89 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Catsperg2C6KI89 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Catsperg2C6KI89 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Catsperg2C6KI89 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Catsperg2C6KI89 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 182.4 ms