Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm17333C6EQI3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm17333C6EQI3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm17333C6EQI3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm17333C6EQI3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm17333C6EQI3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm17333C6EQI3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm17333C6EQI3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm17333C6EQI3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm17333C6EQI3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm17333C6EQI3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm17333C6EQI3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm17333C6EQI3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm17333C6EQI3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm17333C6EQI3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm17333C6EQI3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm17333C6EQI3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm17333C6EQI3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm17333C6EQI3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm17333C6EQI3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm17333C6EQI3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm17333C6EQI3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm17333C6EQI3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm17333C6EQI3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm17333C6EQI3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm17333C6EQI3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm17333C6EQI3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm17333C6EQI3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm17333C6EQI3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm17333C6EQI3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm17333C6EQI3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm17333C6EQI3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm17333C6EQI3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm17333C6EQI3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm17333C6EQI3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm17333C6EQI3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm17333C6EQI3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm17333C6EQI3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm17333C6EQI3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm17333C6EQI3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm17333C6EQI3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm17333C6EQI3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm17333C6EQI3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm17333C6EQI3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm17333C6EQI3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm17333C6EQI3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm17333C6EQI3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm17333C6EQI3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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Gm17333C6EQI3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm17333C6EQI3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm17333C6EQI3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm17333C6EQI3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm17333C6EQI3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm17333C6EQI3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm17333C6EQI3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm17333C6EQI3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm17333C6EQI3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm17333C6EQI3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm17333C6EQI3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm17333C6EQI3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm17333C6EQI3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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Gm17333C6EQI3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm17333C6EQI3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm17333C6EQI3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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Gm17333C6EQI3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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Gm17333C6EQI3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm17333C6EQI3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm17333C6EQI3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm17333C6EQI3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm17333C6EQI3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm17333C6EQI3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm17333C6EQI3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm17333C6EQI3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm17333C6EQI3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm17333C6EQI3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm17333C6EQI3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm17333C6EQI3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm17333C6EQI3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm17333C6EQI3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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