Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlrc5C3VPR6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlrc5C3VPR6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nlrc5C3VPR6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nlrc5C3VPR6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nlrc5C3VPR6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Nlrc5C3VPR6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nlrc5C3VPR6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nlrc5C3VPR6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nlrc5C3VPR6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nlrc5C3VPR6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrc5C3VPR6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrc5C3VPR6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrc5C3VPR6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrc5C3VPR6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrc5C3VPR6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrc5C3VPR6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlrc5C3VPR6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlrc5C3VPR6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrc5C3VPR6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrc5C3VPR6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrc5C3VPR6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrc5C3VPR6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrc5C3VPR6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrc5C3VPR6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrc5C3VPR6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrc5C3VPR6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrc5C3VPR6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrc5C3VPR6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrc5C3VPR6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrc5C3VPR6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrc5C3VPR6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrc5C3VPR6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrc5C3VPR6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlrc5C3VPR6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlrc5C3VPR6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlrc5C3VPR6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlrc5C3VPR6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlrc5C3VPR6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlrc5C3VPR6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlrc5C3VPR6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlrc5C3VPR6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlrc5C3VPR6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlrc5C3VPR6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nlrc5C3VPR6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrc5C3VPR6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrc5C3VPR6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrc5C3VPR6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrc5C3VPR6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrc5C3VPR6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrc5C3VPR6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrc5C3VPR6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrc5C3VPR6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrc5C3VPR6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrc5C3VPR6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrc5C3VPR6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrc5C3VPR6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrc5C3VPR6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrc5C3VPR6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrc5C3VPR6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrc5C3VPR6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrc5C3VPR6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrc5C3VPR6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrc5C3VPR6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrc5C3VPR6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrc5C3VPR6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrc5C3VPR6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrc5C3VPR6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrc5C3VPR6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrc5C3VPR6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrc5C3VPR6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrc5C3VPR6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrc5C3VPR6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrc5C3VPR6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrc5C3VPR6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrc5C3VPR6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrc5C3VPR6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrc5C3VPR6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrc5C3VPR6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrc5C3VPR6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrc5C3VPR6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrc5C3VPR6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrc5C3VPR6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrc5C3VPR6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrc5C3VPR6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrc5C3VPR6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrc5C3VPR6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrc5C3VPR6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrc5C3VPR6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrc5C3VPR6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrc5C3VPR6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrc5C3VPR6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrc5C3VPR6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrc5C3VPR6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrc5C3VPR6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrc5C3VPR6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrc5C3VPR6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrc5C3VPR6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrc5C3VPR6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrc5C3VPR6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms