Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Phf11bB4XVQ1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Phf11bB4XVQ1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Phf11bB4XVQ1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Phf11bB4XVQ1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Phf11bB4XVQ1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Phf11bB4XVQ1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Phf11bB4XVQ1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Phf11bB4XVQ1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Phf11bB4XVQ1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Phf11bB4XVQ1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Phf11bB4XVQ1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Phf11bB4XVQ1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Phf11bB4XVQ1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Phf11bB4XVQ1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Phf11bB4XVQ1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Phf11bB4XVQ1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Phf11bB4XVQ1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Phf11bB4XVQ1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Phf11bB4XVQ1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Phf11bB4XVQ1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Phf11bB4XVQ1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Phf11bB4XVQ1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Phf11bB4XVQ1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Phf11bB4XVQ1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Phf11bB4XVQ1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Phf11bB4XVQ1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Phf11bB4XVQ1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Phf11bB4XVQ1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Phf11bB4XVQ1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Phf11bB4XVQ1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Phf11bB4XVQ1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Phf11bB4XVQ1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Phf11bB4XVQ1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Phf11bB4XVQ1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Phf11bB4XVQ1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Phf11bB4XVQ1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Phf11bB4XVQ1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Phf11bB4XVQ1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Phf11bB4XVQ1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Phf11bB4XVQ1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Phf11bB4XVQ1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Phf11bB4XVQ1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Phf11bB4XVQ1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Phf11bB4XVQ1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Phf11bB4XVQ1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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