Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Otud7bB2RUR8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Otud7bB2RUR8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Otud7bB2RUR8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Otud7bB2RUR8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Otud7bB2RUR8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Otud7bB2RUR8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Otud7bB2RUR8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Otud7bB2RUR8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Otud7bB2RUR8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Otud7bB2RUR8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Otud7bB2RUR8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Otud7bB2RUR8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Otud7bB2RUR8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Otud7bB2RUR8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Otud7bB2RUR8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Otud7bB2RUR8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Otud7bB2RUR8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Otud7bB2RUR8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Otud7bB2RUR8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Otud7bB2RUR8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Otud7bB2RUR8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Otud7bB2RUR8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Otud7bB2RUR8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Otud7bB2RUR8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Otud7bB2RUR8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Otud7bB2RUR8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Otud7bB2RUR8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Otud7bB2RUR8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Otud7bB2RUR8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Otud7bB2RUR8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Otud7bB2RUR8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Otud7bB2RUR8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Otud7bB2RUR8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Otud7bB2RUR8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Otud7bB2RUR8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Otud7bB2RUR8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Otud7bB2RUR8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Otud7bB2RUR8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Otud7bB2RUR8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Otud7bB2RUR8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Otud7bB2RUR8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Otud7bB2RUR8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Otud7bB2RUR8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Otud7bB2RUR8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Otud7bB2RUR8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Otud7bB2RUR8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Otud7bB2RUR8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Otud7bB2RUR8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Otud7bB2RUR8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Otud7bB2RUR8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Otud7bB2RUR8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Otud7bB2RUR8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Otud7bB2RUR8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Otud7bB2RUR8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Otud7bB2RUR8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Otud7bB2RUR8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Otud7bB2RUR8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Otud7bB2RUR8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Otud7bB2RUR8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Otud7bB2RUR8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Otud7bB2RUR8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Otud7bB2RUR8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Otud7bB2RUR8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Otud7bB2RUR8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Otud7bB2RUR8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Otud7bB2RUR8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Otud7bB2RUR8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Otud7bB2RUR8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Otud7bB2RUR8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Otud7bB2RUR8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Otud7bB2RUR8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Otud7bB2RUR8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Otud7bB2RUR8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Otud7bB2RUR8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Otud7bB2RUR8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Otud7bB2RUR8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Otud7bB2RUR8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Otud7bB2RUR8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Otud7bB2RUR8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Otud7bB2RUR8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Otud7bB2RUR8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Otud7bB2RUR8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Otud7bB2RUR8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Otud7bB2RUR8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Otud7bB2RUR8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Otud7bB2RUR8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Otud7bB2RUR8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Otud7bB2RUR8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Otud7bB2RUR8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Otud7bB2RUR8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Otud7bB2RUR8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Otud7bB2RUR8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Otud7bB2RUR8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Otud7bB2RUR8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Otud7bB2RUR8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Otud7bB2RUR8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Otud7bB2RUR8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Otud7bB2RUR8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Otud7bB2RUR8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms