Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apba1B2RUJ5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apba1B2RUJ5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apba1B2RUJ5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apba1B2RUJ5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Apba1B2RUJ5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apba1B2RUJ5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Apba1B2RUJ5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apba1B2RUJ5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Apba1B2RUJ5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apba1B2RUJ5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apba1B2RUJ5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apba1B2RUJ5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apba1B2RUJ5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apba1B2RUJ5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apba1B2RUJ5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apba1B2RUJ5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apba1B2RUJ5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apba1B2RUJ5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apba1B2RUJ5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apba1B2RUJ5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apba1B2RUJ5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apba1B2RUJ5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apba1B2RUJ5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apba1B2RUJ5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apba1B2RUJ5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apba1B2RUJ5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apba1B2RUJ5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apba1B2RUJ5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apba1B2RUJ5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apba1B2RUJ5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apba1B2RUJ5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apba1B2RUJ5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apba1B2RUJ5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apba1B2RUJ5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apba1B2RUJ5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Apba1B2RUJ5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Apba1B2RUJ5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apba1B2RUJ5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apba1B2RUJ5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apba1B2RUJ5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apba1B2RUJ5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apba1B2RUJ5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apba1B2RUJ5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apba1B2RUJ5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apba1B2RUJ5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apba1B2RUJ5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apba1B2RUJ5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apba1B2RUJ5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apba1B2RUJ5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apba1B2RUJ5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apba1B2RUJ5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apba1B2RUJ5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Apba1B2RUJ5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apba1B2RUJ5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apba1B2RUJ5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apba1B2RUJ5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apba1B2RUJ5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apba1B2RUJ5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apba1B2RUJ5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Apba1B2RUJ5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Apba1B2RUJ5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Apba1B2RUJ5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Apba1B2RUJ5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Apba1B2RUJ5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Apba1B2RUJ5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Apba1B2RUJ5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Apba1B2RUJ5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Apba1B2RUJ5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apba1B2RUJ5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apba1B2RUJ5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apba1B2RUJ5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apba1B2RUJ5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apba1B2RUJ5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apba1B2RUJ5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apba1B2RUJ5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apba1B2RUJ5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apba1B2RUJ5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apba1B2RUJ5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apba1B2RUJ5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apba1B2RUJ5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apba1B2RUJ5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apba1B2RUJ5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apba1B2RUJ5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apba1B2RUJ5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apba1B2RUJ5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apba1B2RUJ5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apba1B2RUJ5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apba1B2RUJ5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apba1B2RUJ5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apba1B2RUJ5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apba1B2RUJ5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apba1B2RUJ5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apba1B2RUJ5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apba1B2RUJ5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apba1B2RUJ5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apba1B2RUJ5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apba1B2RUJ5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apba1B2RUJ5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apba1B2RUJ5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms