Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprbB2RU80 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprbB2RU80 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprbB2RU80 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprbB2RU80 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprbB2RU80 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprbB2RU80 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprbB2RU80 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprbB2RU80 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprbB2RU80 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprbB2RU80 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprbB2RU80 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprbB2RU80 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprbB2RU80 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprbB2RU80 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprbB2RU80 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprbB2RU80 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprbB2RU80 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprbB2RU80 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprbB2RU80 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprbB2RU80 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprbB2RU80 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprbB2RU80 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprbB2RU80 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprbB2RU80 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprbB2RU80 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprbB2RU80 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprbB2RU80 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprbB2RU80 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprbB2RU80 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprbB2RU80 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprbB2RU80 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprbB2RU80 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprbB2RU80 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprbB2RU80 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprbB2RU80 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprbB2RU80 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprbB2RU80 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprbB2RU80 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprbB2RU80 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprbB2RU80 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprbB2RU80 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PtprbB2RU80 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PtprbB2RU80 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PtprbB2RU80 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprbB2RU80 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprbB2RU80 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprbB2RU80 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprbB2RU80 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprbB2RU80 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprbB2RU80 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprbB2RU80 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprbB2RU80 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprbB2RU80 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprbB2RU80 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprbB2RU80 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprbB2RU80 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprbB2RU80 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprbB2RU80 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprbB2RU80 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprbB2RU80 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprbB2RU80 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprbB2RU80 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprbB2RU80 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprbB2RU80 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprbB2RU80 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprbB2RU80 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprbB2RU80 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprbB2RU80 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprbB2RU80 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprbB2RU80 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprbB2RU80 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprbB2RU80 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprbB2RU80 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprbB2RU80 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprbB2RU80 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprbB2RU80 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprbB2RU80 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprbB2RU80 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprbB2RU80 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprbB2RU80 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprbB2RU80 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprbB2RU80 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprbB2RU80 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprbB2RU80 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprbB2RU80 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprbB2RU80 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprbB2RU80 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprbB2RU80 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprbB2RU80 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprbB2RU80 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprbB2RU80 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprbB2RU80 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprbB2RU80 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprbB2RU80 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprbB2RU80 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprbB2RU80 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprbB2RU80 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprbB2RU80 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprbB2RU80 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms