Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPBD1B2RD01 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPBD1B2RD01 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPBD1B2RD01 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPBD1B2RD01 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPBD1B2RD01 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPBD1B2RD01 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPBD1B2RD01 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CENPBD1B2RD01 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
CENPBD1B2RD01 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CENPBD1B2RD01 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPBD1B2RD01 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPBD1B2RD01 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPBD1B2RD01 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPBD1B2RD01 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPBD1B2RD01 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPBD1B2RD01 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPBD1B2RD01 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPBD1B2RD01 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPBD1B2RD01 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPBD1B2RD01 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPBD1B2RD01 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPBD1B2RD01 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPBD1B2RD01 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPBD1B2RD01 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPBD1B2RD01 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPBD1B2RD01 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPBD1B2RD01 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPBD1B2RD01 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPBD1B2RD01 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPBD1B2RD01 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPBD1B2RD01 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPBD1B2RD01 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPBD1B2RD01 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPBD1B2RD01 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPBD1B2RD01 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPBD1B2RD01 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPBD1B2RD01 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPBD1B2RD01 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPBD1B2RD01 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPBD1B2RD01 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPBD1B2RD01 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPBD1B2RD01 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPBD1B2RD01 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPBD1B2RD01 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.4 ms