Protein–RNA interactions for Protein: B1ARW8

Uncharacterized protein C1orf122 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B1ARW8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
B1ARW8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
B1ARW8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B1ARW8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B1ARW8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
B1ARW8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B1ARW8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B1ARW8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B1ARW8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
B1ARW8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
B1ARW8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B1ARW8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B1ARW8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B1ARW8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B1ARW8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
B1ARW8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B1ARW8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B1ARW8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B1ARW8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B1ARW8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B1ARW8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B1ARW8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B1ARW8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B1ARW8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B1ARW8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B1ARW8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B1ARW8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B1ARW8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B1ARW8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B1ARW8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B1ARW8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B1ARW8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B1ARW8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B1ARW8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B1ARW8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
B1ARW8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
B1ARW8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
B1ARW8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
B1ARW8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
B1ARW8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
B1ARW8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
B1ARW8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
B1ARW8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
B1ARW8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
B1ARW8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B1ARW8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B1ARW8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B1ARW8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
B1ARW8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B1ARW8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B1ARW8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B1ARW8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B1ARW8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B1ARW8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
B1ARW8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
B1ARW8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
B1ARW8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
B1ARW8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
B1ARW8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
B1ARW8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
B1ARW8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
B1ARW8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
B1ARW8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
B1ARW8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
B1ARW8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
B1ARW8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B1ARW8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
B1ARW8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B1ARW8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
B1ARW8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
B1ARW8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B1ARW8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B1ARW8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B1ARW8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
B1ARW8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
B1ARW8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
B1ARW8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
B1ARW8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
B1ARW8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
B1ARW8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
B1ARW8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
B1ARW8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
B1ARW8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
B1ARW8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
B1ARW8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
B1ARW8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
B1ARW8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
B1ARW8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
B1ARW8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
B1ARW8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
B1ARW8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
B1ARW8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
B1ARW8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
B1ARW8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
B1ARW8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
B1ARW8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
B1ARW8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
B1ARW8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
B1ARW8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
B1ARW8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms