Protein–RNA interactions for Protein: A8MUH7

PDZK1P1, Putative PDZ domain-containing protein PDZK1P1, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1P1A8MUH7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZK1P1A8MUH7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZK1P1A8MUH7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZK1P1A8MUH7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZK1P1A8MUH7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZK1P1A8MUH7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZK1P1A8MUH7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZK1P1A8MUH7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZK1P1A8MUH7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZK1P1A8MUH7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZK1P1A8MUH7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZK1P1A8MUH7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZK1P1A8MUH7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZK1P1A8MUH7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZK1P1A8MUH7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZK1P1A8MUH7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDZK1P1A8MUH7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDZK1P1A8MUH7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDZK1P1A8MUH7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDZK1P1A8MUH7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDZK1P1A8MUH7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDZK1P1A8MUH7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDZK1P1A8MUH7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDZK1P1A8MUH7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDZK1P1A8MUH7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDZK1P1A8MUH7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PDZK1P1A8MUH7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDZK1P1A8MUH7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDZK1P1A8MUH7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDZK1P1A8MUH7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDZK1P1A8MUH7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDZK1P1A8MUH7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDZK1P1A8MUH7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDZK1P1A8MUH7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDZK1P1A8MUH7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDZK1P1A8MUH7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PDZK1P1A8MUH7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PDZK1P1A8MUH7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDZK1P1A8MUH7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDZK1P1A8MUH7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDZK1P1A8MUH7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PDZK1P1A8MUH7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDZK1P1A8MUH7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDZK1P1A8MUH7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDZK1P1A8MUH7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDZK1P1A8MUH7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms