Protein–RNA interactions for Protein: A6NIE6

RRN3P2, Putative RRN3-like protein RRN3P2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P2A6NIE6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RRN3P2A6NIE6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RRN3P2A6NIE6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRN3P2A6NIE6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRN3P2A6NIE6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRN3P2A6NIE6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRN3P2A6NIE6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRN3P2A6NIE6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRN3P2A6NIE6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRN3P2A6NIE6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRN3P2A6NIE6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRN3P2A6NIE6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRN3P2A6NIE6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRN3P2A6NIE6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRN3P2A6NIE6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRN3P2A6NIE6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRN3P2A6NIE6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRN3P2A6NIE6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRN3P2A6NIE6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRN3P2A6NIE6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RRN3P2A6NIE6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRN3P2A6NIE6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRN3P2A6NIE6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRN3P2A6NIE6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RRN3P2A6NIE6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRN3P2A6NIE6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRN3P2A6NIE6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRN3P2A6NIE6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RRN3P2A6NIE6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRN3P2A6NIE6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRN3P2A6NIE6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRN3P2A6NIE6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRN3P2A6NIE6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRN3P2A6NIE6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRN3P2A6NIE6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRN3P2A6NIE6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRN3P2A6NIE6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRN3P2A6NIE6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRN3P2A6NIE6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRN3P2A6NIE6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRN3P2A6NIE6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RRN3P2A6NIE6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RRN3P2A6NIE6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RRN3P2A6NIE6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RRN3P2A6NIE6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RRN3P2A6NIE6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRN3P2A6NIE6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRN3P2A6NIE6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRN3P2A6NIE6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRN3P2A6NIE6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRN3P2A6NIE6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRN3P2A6NIE6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRN3P2A6NIE6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRN3P2A6NIE6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRN3P2A6NIE6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRN3P2A6NIE6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RRN3P2A6NIE6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRN3P2A6NIE6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRN3P2A6NIE6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRN3P2A6NIE6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRN3P2A6NIE6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRN3P2A6NIE6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRN3P2A6NIE6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRN3P2A6NIE6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRN3P2A6NIE6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RRN3P2A6NIE6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRN3P2A6NIE6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRN3P2A6NIE6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRN3P2A6NIE6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRN3P2A6NIE6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRN3P2A6NIE6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRN3P2A6NIE6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRN3P2A6NIE6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRN3P2A6NIE6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRN3P2A6NIE6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRN3P2A6NIE6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRN3P2A6NIE6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRN3P2A6NIE6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRN3P2A6NIE6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRN3P2A6NIE6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRN3P2A6NIE6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRN3P2A6NIE6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRN3P2A6NIE6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRN3P2A6NIE6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RRN3P2A6NIE6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RRN3P2A6NIE6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRN3P2A6NIE6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RRN3P2A6NIE6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRN3P2A6NIE6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRN3P2A6NIE6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRN3P2A6NIE6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRN3P2A6NIE6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRN3P2A6NIE6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRN3P2A6NIE6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRN3P2A6NIE6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RRN3P2A6NIE6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRN3P2A6NIE6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRN3P2A6NIE6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRN3P2A6NIE6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RRN3P2A6NIE6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms