Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf92A6NGG3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf92A6NGG3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.9 ms