Protein–RNA interactions for Protein: A5D6W6

FITM1, Fat storage-inducing transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FITM1A5D6W6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FITM1A5D6W6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FITM1A5D6W6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FITM1A5D6W6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FITM1A5D6W6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FITM1A5D6W6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FITM1A5D6W6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FITM1A5D6W6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FITM1A5D6W6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FITM1A5D6W6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FITM1A5D6W6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FITM1A5D6W6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FITM1A5D6W6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FITM1A5D6W6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FITM1A5D6W6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FITM1A5D6W6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FITM1A5D6W6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FITM1A5D6W6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FITM1A5D6W6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FITM1A5D6W6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FITM1A5D6W6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FITM1A5D6W6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FITM1A5D6W6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FITM1A5D6W6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FITM1A5D6W6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FITM1A5D6W6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FITM1A5D6W6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FITM1A5D6W6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FITM1A5D6W6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FITM1A5D6W6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FITM1A5D6W6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FITM1A5D6W6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FITM1A5D6W6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FITM1A5D6W6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FITM1A5D6W6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FITM1A5D6W6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FITM1A5D6W6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FITM1A5D6W6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FITM1A5D6W6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FITM1A5D6W6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FITM1A5D6W6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FITM1A5D6W6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FITM1A5D6W6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FITM1A5D6W6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FITM1A5D6W6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FITM1A5D6W6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FITM1A5D6W6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FITM1A5D6W6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FITM1A5D6W6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FITM1A5D6W6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FITM1A5D6W6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FITM1A5D6W6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FITM1A5D6W6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FITM1A5D6W6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FITM1A5D6W6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FITM1A5D6W6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FITM1A5D6W6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FITM1A5D6W6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FITM1A5D6W6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FITM1A5D6W6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FITM1A5D6W6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FITM1A5D6W6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FITM1A5D6W6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FITM1A5D6W6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FITM1A5D6W6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FITM1A5D6W6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FITM1A5D6W6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FITM1A5D6W6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FITM1A5D6W6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FITM1A5D6W6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FITM1A5D6W6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FITM1A5D6W6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FITM1A5D6W6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FITM1A5D6W6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FITM1A5D6W6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FITM1A5D6W6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FITM1A5D6W6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FITM1A5D6W6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FITM1A5D6W6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FITM1A5D6W6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FITM1A5D6W6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FITM1A5D6W6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FITM1A5D6W6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FITM1A5D6W6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FITM1A5D6W6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FITM1A5D6W6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FITM1A5D6W6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FITM1A5D6W6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FITM1A5D6W6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FITM1A5D6W6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FITM1A5D6W6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FITM1A5D6W6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FITM1A5D6W6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FITM1A5D6W6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FITM1A5D6W6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FITM1A5D6W6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FITM1A5D6W6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FITM1A5D6W6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FITM1A5D6W6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FITM1A5D6W6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms