Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A4D1N5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
A4D1N5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A4D1N5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A4D1N5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A4D1N5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A4D1N5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A4D1N5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A4D1N5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A4D1N5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4D1N5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4D1N5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4D1N5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4D1N5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
A4D1N5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4D1N5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4D1N5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4D1N5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4D1N5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4D1N5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4D1N5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4D1N5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4D1N5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4D1N5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4D1N5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
A4D1N5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4D1N5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4D1N5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4D1N5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4D1N5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4D1N5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4D1N5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4D1N5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4D1N5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4D1N5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4D1N5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4D1N5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A4D1N5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A4D1N5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A4D1N5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A4D1N5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A4D1N5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A4D1N5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A4D1N5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A4D1N5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A4D1N5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A4D1N5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A4D1N5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A4D1N5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A4D1N5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A4D1N5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A4D1N5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A4D1N5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A4D1N5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A4D1N5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A4D1N5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A4D1N5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A4D1N5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A4D1N5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A4D1N5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
A4D1N5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A4D1N5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A4D1N5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A4D1N5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A4D1N5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A4D1N5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A4D1N5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A4D1N5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A4D1N5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A4D1N5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A4D1N5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A4D1N5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A4D1N5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A4D1N5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A4D1N5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A4D1N5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A4D1N5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A4D1N5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A4D1N5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A4D1N5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A4D1N5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A4D1N5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A4D1N5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
A4D1N5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A4D1N5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A4D1N5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A4D1N5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A4D1N5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A4D1N5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A4D1N5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A4D1N5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A4D1N5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A4D1N5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A4D1N5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A4D1N5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A4D1N5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A4D1N5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A4D1N5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A4D1N5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A4D1N5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 982.2 ms