Protein–RNA interactions for Protein: A2AMT7

Vmn1r3, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r3A2AMT7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r3A2AMT7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r3A2AMT7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r3A2AMT7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r3A2AMT7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r3A2AMT7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r3A2AMT7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r3A2AMT7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r3A2AMT7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r3A2AMT7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Vmn1r3A2AMT7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Vmn1r3A2AMT7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r3A2AMT7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r3A2AMT7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r3A2AMT7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r3A2AMT7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r3A2AMT7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r3A2AMT7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r3A2AMT7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r3A2AMT7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r3A2AMT7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r3A2AMT7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r3A2AMT7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r3A2AMT7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r3A2AMT7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r3A2AMT7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r3A2AMT7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r3A2AMT7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r3A2AMT7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r3A2AMT7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r3A2AMT7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r3A2AMT7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r3A2AMT7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r3A2AMT7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r3A2AMT7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r3A2AMT7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r3A2AMT7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r3A2AMT7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r3A2AMT7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r3A2AMT7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r3A2AMT7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r3A2AMT7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r3A2AMT7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r3A2AMT7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r3A2AMT7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r3A2AMT7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r3A2AMT7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r3A2AMT7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r3A2AMT7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r3A2AMT7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r3A2AMT7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r3A2AMT7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r3A2AMT7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r3A2AMT7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r3A2AMT7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r3A2AMT7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r3A2AMT7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r3A2AMT7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r3A2AMT7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r3A2AMT7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r3A2AMT7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r3A2AMT7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r3A2AMT7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r3A2AMT7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r3A2AMT7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r3A2AMT7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r3A2AMT7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r3A2AMT7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r3A2AMT7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r3A2AMT7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r3A2AMT7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r3A2AMT7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r3A2AMT7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r3A2AMT7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r3A2AMT7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r3A2AMT7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r3A2AMT7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r3A2AMT7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r3A2AMT7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r3A2AMT7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r3A2AMT7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r3A2AMT7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r3A2AMT7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r3A2AMT7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r3A2AMT7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r3A2AMT7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r3A2AMT7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r3A2AMT7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r3A2AMT7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r3A2AMT7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r3A2AMT7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r3A2AMT7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r3A2AMT7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r3A2AMT7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r3A2AMT7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r3A2AMT7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r3A2AMT7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r3A2AMT7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r3A2AMT7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r3A2AMT7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms