Protein–RNA interactions for Protein: A2AKM2

Hacd4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd4A2AKM2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hacd4A2AKM2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hacd4A2AKM2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hacd4A2AKM2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hacd4A2AKM2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hacd4A2AKM2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hacd4A2AKM2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hacd4A2AKM2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hacd4A2AKM2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hacd4A2AKM2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hacd4A2AKM2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hacd4A2AKM2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hacd4A2AKM2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hacd4A2AKM2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hacd4A2AKM2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hacd4A2AKM2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hacd4A2AKM2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hacd4A2AKM2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hacd4A2AKM2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hacd4A2AKM2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hacd4A2AKM2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hacd4A2AKM2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hacd4A2AKM2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hacd4A2AKM2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hacd4A2AKM2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hacd4A2AKM2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hacd4A2AKM2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hacd4A2AKM2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hacd4A2AKM2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hacd4A2AKM2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hacd4A2AKM2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hacd4A2AKM2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hacd4A2AKM2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hacd4A2AKM2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hacd4A2AKM2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hacd4A2AKM2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms