Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pramel3A2AHA7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pramel3A2AHA7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pramel3A2AHA7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pramel3A2AHA7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pramel3A2AHA7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pramel3A2AHA7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pramel3A2AHA7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pramel3A2AHA7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pramel3A2AHA7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pramel3A2AHA7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pramel3A2AHA7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pramel3A2AHA7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pramel3A2AHA7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pramel3A2AHA7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pramel3A2AHA7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pramel3A2AHA7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pramel3A2AHA7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pramel3A2AHA7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pramel3A2AHA7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pramel3A2AHA7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pramel3A2AHA7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pramel3A2AHA7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pramel3A2AHA7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pramel3A2AHA7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pramel3A2AHA7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pramel3A2AHA7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pramel3A2AHA7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pramel3A2AHA7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pramel3A2AHA7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pramel3A2AHA7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Pramel3A2AHA7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pramel3A2AHA7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pramel3A2AHA7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pramel3A2AHA7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pramel3A2AHA7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pramel3A2AHA7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pramel3A2AHA7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pramel3A2AHA7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pramel3A2AHA7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pramel3A2AHA7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pramel3A2AHA7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Pramel3A2AHA7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Pramel3A2AHA7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pramel3A2AHA7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pramel3A2AHA7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pramel3A2AHA7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pramel3A2AHA7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pramel3A2AHA7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pramel3A2AHA7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pramel3A2AHA7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pramel3A2AHA7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pramel3A2AHA7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Pramel3A2AHA7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pramel3A2AHA7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pramel3A2AHA7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pramel3A2AHA7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pramel3A2AHA7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pramel3A2AHA7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pramel3A2AHA7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pramel3A2AHA7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pramel3A2AHA7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pramel3A2AHA7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pramel3A2AHA7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pramel3A2AHA7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pramel3A2AHA7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pramel3A2AHA7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pramel3A2AHA7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pramel3A2AHA7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pramel3A2AHA7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pramel3A2AHA7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pramel3A2AHA7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pramel3A2AHA7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pramel3A2AHA7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pramel3A2AHA7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pramel3A2AHA7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pramel3A2AHA7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pramel3A2AHA7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pramel3A2AHA7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pramel3A2AHA7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pramel3A2AHA7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pramel3A2AHA7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pramel3A2AHA7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pramel3A2AHA7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pramel3A2AHA7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pramel3A2AHA7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pramel3A2AHA7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pramel3A2AHA7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pramel3A2AHA7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pramel3A2AHA7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pramel3A2AHA7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pramel3A2AHA7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pramel3A2AHA7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pramel3A2AHA7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pramel3A2AHA7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Pramel3A2AHA7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pramel3A2AHA7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pramel3A2AHA7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pramel3A2AHA7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pramel3A2AHA7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms