Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Col9a3A2ACT7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Col9a3A2ACT7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Col9a3A2ACT7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Col9a3A2ACT7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Col9a3A2ACT7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Col9a3A2ACT7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Col9a3A2ACT7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Col9a3A2ACT7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Col9a3A2ACT7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Col9a3A2ACT7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Col9a3A2ACT7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Col9a3A2ACT7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Col9a3A2ACT7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Col9a3A2ACT7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col9a3A2ACT7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col9a3A2ACT7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col9a3A2ACT7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Col9a3A2ACT7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Col9a3A2ACT7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Col9a3A2ACT7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Col9a3A2ACT7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Col9a3A2ACT7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Col9a3A2ACT7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Col9a3A2ACT7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Col9a3A2ACT7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col9a3A2ACT7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col9a3A2ACT7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col9a3A2ACT7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col9a3A2ACT7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col9a3A2ACT7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col9a3A2ACT7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Col9a3A2ACT7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Col9a3A2ACT7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Col9a3A2ACT7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Col9a3A2ACT7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Col9a3A2ACT7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Col9a3A2ACT7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Col9a3A2ACT7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Col9a3A2ACT7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Col9a3A2ACT7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Col9a3A2ACT7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Col9a3A2ACT7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Col9a3A2ACT7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Col9a3A2ACT7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Col9a3A2ACT7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Col9a3A2ACT7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Col9a3A2ACT7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Col9a3A2ACT7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Col9a3A2ACT7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Col9a3A2ACT7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Col9a3A2ACT7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Col9a3A2ACT7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Col9a3A2ACT7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Col9a3A2ACT7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Col9a3A2ACT7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Col9a3A2ACT7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Col9a3A2ACT7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Col9a3A2ACT7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Col9a3A2ACT7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Col9a3A2ACT7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Col9a3A2ACT7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Col9a3A2ACT7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Col9a3A2ACT7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Col9a3A2ACT7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Col9a3A2ACT7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Col9a3A2ACT7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Col9a3A2ACT7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Col9a3A2ACT7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Col9a3A2ACT7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Col9a3A2ACT7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Col9a3A2ACT7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Col9a3A2ACT7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Col9a3A2ACT7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Col9a3A2ACT7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Col9a3A2ACT7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Col9a3A2ACT7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Col9a3A2ACT7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Col9a3A2ACT7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Col9a3A2ACT7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Col9a3A2ACT7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Col9a3A2ACT7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Col9a3A2ACT7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Col9a3A2ACT7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Col9a3A2ACT7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Col9a3A2ACT7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Col9a3A2ACT7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Col9a3A2ACT7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Col9a3A2ACT7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Col9a3A2ACT7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Col9a3A2ACT7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Col9a3A2ACT7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Col9a3A2ACT7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Col9a3A2ACT7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Col9a3A2ACT7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Col9a3A2ACT7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Col9a3A2ACT7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Col9a3A2ACT7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Col9a3A2ACT7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Col9a3A2ACT7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms