Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Itgb4A2A863 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Itgb4A2A863 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Itgb4A2A863 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Itgb4A2A863 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Itgb4A2A863 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Itgb4A2A863 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Itgb4A2A863 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Itgb4A2A863 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Itgb4A2A863 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Itgb4A2A863 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Itgb4A2A863 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Itgb4A2A863 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Itgb4A2A863 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Itgb4A2A863 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Itgb4A2A863 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Itgb4A2A863 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Itgb4A2A863 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Itgb4A2A863 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Itgb4A2A863 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Itgb4A2A863 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Itgb4A2A863 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Itgb4A2A863 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Itgb4A2A863 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Itgb4A2A863 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Itgb4A2A863 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Itgb4A2A863 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Itgb4A2A863 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Itgb4A2A863 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Itgb4A2A863 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Itgb4A2A863 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Itgb4A2A863 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Itgb4A2A863 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Itgb4A2A863 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Itgb4A2A863 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Itgb4A2A863 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Itgb4A2A863 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Itgb4A2A863 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Itgb4A2A863 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Itgb4A2A863 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Itgb4A2A863 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Itgb4A2A863 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Itgb4A2A863 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Itgb4A2A863 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Itgb4A2A863 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Itgb4A2A863 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Itgb4A2A863 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Itgb4A2A863 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Itgb4A2A863 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Itgb4A2A863 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Itgb4A2A863 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Itgb4A2A863 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Itgb4A2A863 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Itgb4A2A863 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Itgb4A2A863 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Itgb4A2A863 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Itgb4A2A863 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Itgb4A2A863 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Itgb4A2A863 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Itgb4A2A863 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Itgb4A2A863 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Itgb4A2A863 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Itgb4A2A863 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Itgb4A2A863 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Itgb4A2A863 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Itgb4A2A863 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Itgb4A2A863 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Itgb4A2A863 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Itgb4A2A863 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Itgb4A2A863 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Itgb4A2A863 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Itgb4A2A863 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Itgb4A2A863 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Itgb4A2A863 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Itgb4A2A863 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Itgb4A2A863 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Itgb4A2A863 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Itgb4A2A863 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Itgb4A2A863 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Itgb4A2A863 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Itgb4A2A863 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Itgb4A2A863 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Itgb4A2A863 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Itgb4A2A863 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Itgb4A2A863 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Itgb4A2A863 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Itgb4A2A863 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Itgb4A2A863 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Itgb4A2A863 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Itgb4A2A863 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Itgb4A2A863 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Itgb4A2A863 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Itgb4A2A863 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Itgb4A2A863 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Itgb4A2A863 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Itgb4A2A863 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Itgb4A2A863 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Itgb4A2A863 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Itgb4A2A863 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Itgb4A2A863 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms