Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm27029A2A4P4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm27029A2A4P4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm27029A2A4P4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm27029A2A4P4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm27029A2A4P4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm27029A2A4P4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm27029A2A4P4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm27029A2A4P4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm27029A2A4P4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm27029A2A4P4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm27029A2A4P4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm27029A2A4P4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm27029A2A4P4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm27029A2A4P4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm27029A2A4P4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm27029A2A4P4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm27029A2A4P4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm27029A2A4P4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm27029A2A4P4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm27029A2A4P4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm27029A2A4P4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm27029A2A4P4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm27029A2A4P4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm27029A2A4P4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm27029A2A4P4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm27029A2A4P4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm27029A2A4P4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm27029A2A4P4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gm27029A2A4P4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm27029A2A4P4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm27029A2A4P4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm27029A2A4P4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm27029A2A4P4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm27029A2A4P4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm27029A2A4P4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm27029A2A4P4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm27029A2A4P4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm27029A2A4P4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm27029A2A4P4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm27029A2A4P4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm27029A2A4P4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm27029A2A4P4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm27029A2A4P4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm27029A2A4P4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm27029A2A4P4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm27029A2A4P4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm27029A2A4P4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm27029A2A4P4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm27029A2A4P4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm27029A2A4P4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm27029A2A4P4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm27029A2A4P4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm27029A2A4P4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm27029A2A4P4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm27029A2A4P4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm27029A2A4P4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm27029A2A4P4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm27029A2A4P4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm27029A2A4P4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm27029A2A4P4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm27029A2A4P4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm27029A2A4P4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm27029A2A4P4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm27029A2A4P4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm27029A2A4P4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm27029A2A4P4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm27029A2A4P4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm27029A2A4P4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm27029A2A4P4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm27029A2A4P4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm27029A2A4P4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm27029A2A4P4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm27029A2A4P4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm27029A2A4P4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm27029A2A4P4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm27029A2A4P4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm27029A2A4P4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm27029A2A4P4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm27029A2A4P4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm27029A2A4P4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm27029A2A4P4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm27029A2A4P4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm27029A2A4P4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm27029A2A4P4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm27029A2A4P4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm27029A2A4P4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm27029A2A4P4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm27029A2A4P4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm27029A2A4P4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm27029A2A4P4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm27029A2A4P4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm27029A2A4P4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm27029A2A4P4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm27029A2A4P4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm27029A2A4P4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm27029A2A4P4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm27029A2A4P4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm27029A2A4P4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm27029A2A4P4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms