Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POTEB3A0JP26 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POTEB3A0JP26 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POTEB3A0JP26 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POTEB3A0JP26 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POTEB3A0JP26 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POTEB3A0JP26 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POTEB3A0JP26 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POTEB3A0JP26 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
POTEB3A0JP26 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POTEB3A0JP26 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POTEB3A0JP26 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POTEB3A0JP26 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POTEB3A0JP26 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POTEB3A0JP26 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POTEB3A0JP26 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POTEB3A0JP26 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POTEB3A0JP26 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POTEB3A0JP26 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
POTEB3A0JP26 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POTEB3A0JP26 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POTEB3A0JP26 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POTEB3A0JP26 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POTEB3A0JP26 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POTEB3A0JP26 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POTEB3A0JP26 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POTEB3A0JP26 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POTEB3A0JP26 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POTEB3A0JP26 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POTEB3A0JP26 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POTEB3A0JP26 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POTEB3A0JP26 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POTEB3A0JP26 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POTEB3A0JP26 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
POTEB3A0JP26 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
POTEB3A0JP26 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
POTEB3A0JP26 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
POTEB3A0JP26 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
POTEB3A0JP26 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
POTEB3A0JP26 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
POTEB3A0JP26 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
POTEB3A0JP26 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POTEB3A0JP26 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POTEB3A0JP26 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POTEB3A0JP26 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POTEB3A0JP26 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
POTEB3A0JP26 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
POTEB3A0JP26 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
POTEB3A0JP26 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
POTEB3A0JP26 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
POTEB3A0JP26 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POTEB3A0JP26 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POTEB3A0JP26 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POTEB3A0JP26 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
POTEB3A0JP26 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POTEB3A0JP26 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
POTEB3A0JP26 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
POTEB3A0JP26 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POTEB3A0JP26 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POTEB3A0JP26 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POTEB3A0JP26 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POTEB3A0JP26 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POTEB3A0JP26 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POTEB3A0JP26 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POTEB3A0JP26 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POTEB3A0JP26 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POTEB3A0JP26 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POTEB3A0JP26 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POTEB3A0JP26 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
POTEB3A0JP26 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
POTEB3A0JP26 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
POTEB3A0JP26 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
POTEB3A0JP26 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
POTEB3A0JP26 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POTEB3A0JP26 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
POTEB3A0JP26 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POTEB3A0JP26 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
POTEB3A0JP26 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
POTEB3A0JP26 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
POTEB3A0JP26 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POTEB3A0JP26 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
POTEB3A0JP26 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
POTEB3A0JP26 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
POTEB3A0JP26 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
POTEB3A0JP26 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POTEB3A0JP26 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POTEB3A0JP26 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POTEB3A0JP26 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
POTEB3A0JP26 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
POTEB3A0JP26 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POTEB3A0JP26 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POTEB3A0JP26 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POTEB3A0JP26 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
POTEB3A0JP26 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POTEB3A0JP26 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POTEB3A0JP26 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
POTEB3A0JP26 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POTEB3A0JP26 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POTEB3A0JP26 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POTEB3A0JP26 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms