Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933424G06RikA0A140LIP3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
4933424G06RikA0A140LIP3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
4933424G06RikA0A140LIP3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933424G06RikA0A140LIP3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4933424G06RikA0A140LIP3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4933424G06RikA0A140LIP3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933424G06RikA0A140LIP3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
4933424G06RikA0A140LIP3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
4933424G06RikA0A140LIP3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms