Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
6430628N08RikA0A0U1RQ45 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
6430628N08RikA0A0U1RQ45 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
6430628N08RikA0A0U1RQ45 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
6430628N08RikA0A0U1RQ45 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
6430628N08RikA0A0U1RQ45 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms