Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700028J19RikA0A0U1RP08 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700028J19RikA0A0U1RP08 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700028J19RikA0A0U1RP08 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700028J19RikA0A0U1RP08 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700028J19RikA0A0U1RP08 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700028J19RikA0A0U1RP08 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700028J19RikA0A0U1RP08 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700028J19RikA0A0U1RP08 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
1700028J19RikA0A0U1RP08 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
1700028J19RikA0A0U1RP08 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
1700028J19RikA0A0U1RP08 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
1700028J19RikA0A0U1RP08 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
1700028J19RikA0A0U1RP08 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
1700028J19RikA0A0U1RP08 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20■□□□□ 0.79
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
1700028J19RikA0A0U1RP08 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
1700028J19RikA0A0U1RP08 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700028J19RikA0A0U1RP08 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700028J19RikA0A0U1RP08 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
1700028J19RikA0A0U1RP08 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
1700028J19RikA0A0U1RP08 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700028J19RikA0A0U1RP08 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700028J19RikA0A0U1RP08 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700028J19RikA0A0U1RP08 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700028J19RikA0A0U1RP08 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700028J19RikA0A0U1RP08 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700028J19RikA0A0U1RP08 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms