Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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