Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXW6

Igha, Immunoglobulin heavy constant alpha (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IghaA0A0A6YXW6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
IghaA0A0A6YXW6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
IghaA0A0A6YXW6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
IghaA0A0A6YXW6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
IghaA0A0A6YXW6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
IghaA0A0A6YXW6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
IghaA0A0A6YXW6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
IghaA0A0A6YXW6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
IghaA0A0A6YXW6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
IghaA0A0A6YXW6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
IghaA0A0A6YXW6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
IghaA0A0A6YXW6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
IghaA0A0A6YXW6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
IghaA0A0A6YXW6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
IghaA0A0A6YXW6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
IghaA0A0A6YXW6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
IghaA0A0A6YXW6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
IghaA0A0A6YXW6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
IghaA0A0A6YXW6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
IghaA0A0A6YXW6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
IghaA0A0A6YXW6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
IghaA0A0A6YXW6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
IghaA0A0A6YXW6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
IghaA0A0A6YXW6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
IghaA0A0A6YXW6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
IghaA0A0A6YXW6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
IghaA0A0A6YXW6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
IghaA0A0A6YXW6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
IghaA0A0A6YXW6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
IghaA0A0A6YXW6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
IghaA0A0A6YXW6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
IghaA0A0A6YXW6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
IghaA0A0A6YXW6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
IghaA0A0A6YXW6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
IghaA0A0A6YXW6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
IghaA0A0A6YXW6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
IghaA0A0A6YXW6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
IghaA0A0A6YXW6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
IghaA0A0A6YXW6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
IghaA0A0A6YXW6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
IghaA0A0A6YXW6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
IghaA0A0A6YXW6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
IghaA0A0A6YXW6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
IghaA0A0A6YXW6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
IghaA0A0A6YXW6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
IghaA0A0A6YXW6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
IghaA0A0A6YXW6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
IghaA0A0A6YXW6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
IghaA0A0A6YXW6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
IghaA0A0A6YXW6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
IghaA0A0A6YXW6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
IghaA0A0A6YXW6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
IghaA0A0A6YXW6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
IghaA0A0A6YXW6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
IghaA0A0A6YXW6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
IghaA0A0A6YXW6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
IghaA0A0A6YXW6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
IghaA0A0A6YXW6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
IghaA0A0A6YXW6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
IghaA0A0A6YXW6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
IghaA0A0A6YXW6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
IghaA0A0A6YXW6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
IghaA0A0A6YXW6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
IghaA0A0A6YXW6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
IghaA0A0A6YXW6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
IghaA0A0A6YXW6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
IghaA0A0A6YXW6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
IghaA0A0A6YXW6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
IghaA0A0A6YXW6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
IghaA0A0A6YXW6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
IghaA0A0A6YXW6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
IghaA0A0A6YXW6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
IghaA0A0A6YXW6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
IghaA0A0A6YXW6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
IghaA0A0A6YXW6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
IghaA0A0A6YXW6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
IghaA0A0A6YXW6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
IghaA0A0A6YXW6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
IghaA0A0A6YXW6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
IghaA0A0A6YXW6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
IghaA0A0A6YXW6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
IghaA0A0A6YXW6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
IghaA0A0A6YXW6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
IghaA0A0A6YXW6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
IghaA0A0A6YXW6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
IghaA0A0A6YXW6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
IghaA0A0A6YXW6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
IghaA0A0A6YXW6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
IghaA0A0A6YXW6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
IghaA0A0A6YXW6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
IghaA0A0A6YXW6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
IghaA0A0A6YXW6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
IghaA0A0A6YXW6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
IghaA0A0A6YXW6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
IghaA0A0A6YXW6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
IghaA0A0A6YXW6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
IghaA0A0A6YXW6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
IghaA0A0A6YXW6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
IghaA0A0A6YXW6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
IghaA0A0A6YXW6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms