Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
1700019A02RikA0A087WPV9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
1700019A02RikA0A087WPV9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
1700019A02RikA0A087WPV9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
1700019A02RikA0A087WPV9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
1700019A02RikA0A087WPV9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
1700019A02RikA0A087WPV9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
1700019A02RikA0A087WPV9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
1700019A02RikA0A087WPV9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
1700019A02RikA0A087WPV9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
1700019A02RikA0A087WPV9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
1700019A02RikA0A087WPV9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
1700019A02RikA0A087WPV9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
1700019A02RikA0A087WPV9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
1700019A02RikA0A087WPV9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
1700019A02RikA0A087WPV9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
1700019A02RikA0A087WPV9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
1700019A02RikA0A087WPV9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
1700019A02RikA0A087WPV9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
1700019A02RikA0A087WPV9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
1700019A02RikA0A087WPV9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
1700019A02RikA0A087WPV9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
1700019A02RikA0A087WPV9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
1700019A02RikA0A087WPV9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
1700019A02RikA0A087WPV9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
1700019A02RikA0A087WPV9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
1700019A02RikA0A087WPV9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
1700019A02RikA0A087WPV9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
1700019A02RikA0A087WPV9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
1700019A02RikA0A087WPV9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
1700019A02RikA0A087WPV9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
1700019A02RikA0A087WPV9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
1700019A02RikA0A087WPV9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
1700019A02RikA0A087WPV9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
1700019A02RikA0A087WPV9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
1700019A02RikA0A087WPV9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
1700019A02RikA0A087WPV9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
1700019A02RikA0A087WPV9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
1700019A02RikA0A087WPV9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
1700019A02RikA0A087WPV9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms