Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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