Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt27Q9Z320 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt27Q9Z320 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt27Q9Z320 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt27Q9Z320 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt27Q9Z320 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt27Q9Z320 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt27Q9Z320 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt27Q9Z320 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt27Q9Z320 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt27Q9Z320 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt27Q9Z320 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt27Q9Z320 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt27Q9Z320 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt27Q9Z320 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt27Q9Z320 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt27Q9Z320 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt27Q9Z320 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt27Q9Z320 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt27Q9Z320 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt27Q9Z320 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt27Q9Z320 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt27Q9Z320 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt27Q9Z320 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt27Q9Z320 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt27Q9Z320 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt27Q9Z320 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt27Q9Z320 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt27Q9Z320 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt27Q9Z320 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt27Q9Z320 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt27Q9Z320 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt27Q9Z320 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt27Q9Z320 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt27Q9Z320 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt27Q9Z320 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt27Q9Z320 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt27Q9Z320 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt27Q9Z320 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt27Q9Z320 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt27Q9Z320 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt27Q9Z320 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt27Q9Z320 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt27Q9Z320 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Krt27Q9Z320 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt27Q9Z320 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt27Q9Z320 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt27Q9Z320 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt27Q9Z320 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt27Q9Z320 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt27Q9Z320 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt27Q9Z320 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt27Q9Z320 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt27Q9Z320 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt27Q9Z320 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt27Q9Z320 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt27Q9Z320 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt27Q9Z320 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt27Q9Z320 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt27Q9Z320 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt27Q9Z320 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt27Q9Z320 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt27Q9Z320 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt27Q9Z320 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt27Q9Z320 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt27Q9Z320 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt27Q9Z320 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt27Q9Z320 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt27Q9Z320 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt27Q9Z320 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt27Q9Z320 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt27Q9Z320 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt27Q9Z320 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt27Q9Z320 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt27Q9Z320 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt27Q9Z320 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt27Q9Z320 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt27Q9Z320 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt27Q9Z320 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt27Q9Z320 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt27Q9Z320 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt27Q9Z320 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt27Q9Z320 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt27Q9Z320 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt27Q9Z320 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt27Q9Z320 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt27Q9Z320 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt27Q9Z320 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt27Q9Z320 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt27Q9Z320 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt27Q9Z320 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt27Q9Z320 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt27Q9Z320 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt27Q9Z320 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt27Q9Z320 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt27Q9Z320 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt27Q9Z320 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt27Q9Z320 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt27Q9Z320 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt27Q9Z320 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms