Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Knop1Q9Z2Q2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Knop1Q9Z2Q2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Knop1Q9Z2Q2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Knop1Q9Z2Q2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Knop1Q9Z2Q2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Knop1Q9Z2Q2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Knop1Q9Z2Q2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Knop1Q9Z2Q2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Knop1Q9Z2Q2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Knop1Q9Z2Q2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Knop1Q9Z2Q2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Knop1Q9Z2Q2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Knop1Q9Z2Q2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Knop1Q9Z2Q2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Knop1Q9Z2Q2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Knop1Q9Z2Q2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Knop1Q9Z2Q2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Knop1Q9Z2Q2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Knop1Q9Z2Q2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Knop1Q9Z2Q2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Knop1Q9Z2Q2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Knop1Q9Z2Q2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Knop1Q9Z2Q2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Knop1Q9Z2Q2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Knop1Q9Z2Q2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Knop1Q9Z2Q2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Knop1Q9Z2Q2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Knop1Q9Z2Q2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Knop1Q9Z2Q2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Knop1Q9Z2Q2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Knop1Q9Z2Q2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Knop1Q9Z2Q2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Knop1Q9Z2Q2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Knop1Q9Z2Q2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Knop1Q9Z2Q2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Knop1Q9Z2Q2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Knop1Q9Z2Q2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Knop1Q9Z2Q2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Knop1Q9Z2Q2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Knop1Q9Z2Q2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Knop1Q9Z2Q2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Knop1Q9Z2Q2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Knop1Q9Z2Q2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Knop1Q9Z2Q2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Knop1Q9Z2Q2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Knop1Q9Z2Q2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Knop1Q9Z2Q2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Knop1Q9Z2Q2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Knop1Q9Z2Q2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Knop1Q9Z2Q2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Knop1Q9Z2Q2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Knop1Q9Z2Q2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Knop1Q9Z2Q2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Knop1Q9Z2Q2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Knop1Q9Z2Q2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Knop1Q9Z2Q2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Knop1Q9Z2Q2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Knop1Q9Z2Q2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Knop1Q9Z2Q2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Knop1Q9Z2Q2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Knop1Q9Z2Q2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Knop1Q9Z2Q2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Knop1Q9Z2Q2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Knop1Q9Z2Q2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Knop1Q9Z2Q2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Knop1Q9Z2Q2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Knop1Q9Z2Q2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Knop1Q9Z2Q2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Knop1Q9Z2Q2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Knop1Q9Z2Q2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Knop1Q9Z2Q2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Knop1Q9Z2Q2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Knop1Q9Z2Q2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Knop1Q9Z2Q2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Knop1Q9Z2Q2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Knop1Q9Z2Q2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Knop1Q9Z2Q2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Knop1Q9Z2Q2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Knop1Q9Z2Q2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Knop1Q9Z2Q2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Knop1Q9Z2Q2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Knop1Q9Z2Q2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Knop1Q9Z2Q2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Knop1Q9Z2Q2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Knop1Q9Z2Q2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Knop1Q9Z2Q2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Knop1Q9Z2Q2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Knop1Q9Z2Q2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Knop1Q9Z2Q2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Knop1Q9Z2Q2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Knop1Q9Z2Q2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Knop1Q9Z2Q2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Knop1Q9Z2Q2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Knop1Q9Z2Q2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Knop1Q9Z2Q2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Knop1Q9Z2Q2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Knop1Q9Z2Q2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Knop1Q9Z2Q2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Knop1Q9Z2Q2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms