Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp5Q9Z2P8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp5Q9Z2P8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp5Q9Z2P8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp5Q9Z2P8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp5Q9Z2P8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp5Q9Z2P8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp5Q9Z2P8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp5Q9Z2P8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp5Q9Z2P8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp5Q9Z2P8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp5Q9Z2P8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp5Q9Z2P8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp5Q9Z2P8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp5Q9Z2P8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp5Q9Z2P8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp5Q9Z2P8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp5Q9Z2P8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp5Q9Z2P8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp5Q9Z2P8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp5Q9Z2P8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp5Q9Z2P8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp5Q9Z2P8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp5Q9Z2P8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp5Q9Z2P8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp5Q9Z2P8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp5Q9Z2P8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp5Q9Z2P8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp5Q9Z2P8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp5Q9Z2P8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp5Q9Z2P8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp5Q9Z2P8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp5Q9Z2P8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp5Q9Z2P8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp5Q9Z2P8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp5Q9Z2P8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vamp5Q9Z2P8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vamp5Q9Z2P8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vamp5Q9Z2P8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp5Q9Z2P8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp5Q9Z2P8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp5Q9Z2P8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp5Q9Z2P8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp5Q9Z2P8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp5Q9Z2P8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp5Q9Z2P8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp5Q9Z2P8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp5Q9Z2P8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp5Q9Z2P8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vamp5Q9Z2P8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp5Q9Z2P8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp5Q9Z2P8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp5Q9Z2P8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp5Q9Z2P8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp5Q9Z2P8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp5Q9Z2P8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp5Q9Z2P8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp5Q9Z2P8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp5Q9Z2P8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp5Q9Z2P8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp5Q9Z2P8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp5Q9Z2P8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp5Q9Z2P8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp5Q9Z2P8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp5Q9Z2P8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp5Q9Z2P8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp5Q9Z2P8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp5Q9Z2P8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp5Q9Z2P8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp5Q9Z2P8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp5Q9Z2P8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp5Q9Z2P8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp5Q9Z2P8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp5Q9Z2P8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp5Q9Z2P8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp5Q9Z2P8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp5Q9Z2P8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp5Q9Z2P8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp5Q9Z2P8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vamp5Q9Z2P8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp5Q9Z2P8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp5Q9Z2P8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp5Q9Z2P8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp5Q9Z2P8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp5Q9Z2P8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp5Q9Z2P8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp5Q9Z2P8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp5Q9Z2P8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp5Q9Z2P8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp5Q9Z2P8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp5Q9Z2P8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp5Q9Z2P8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp5Q9Z2P8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp5Q9Z2P8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp5Q9Z2P8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp5Q9Z2P8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp5Q9Z2P8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp5Q9Z2P8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp5Q9Z2P8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms