Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C4

Mtmr1, Myotubularin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr1Q9Z2C4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mtmr1Q9Z2C4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mtmr1Q9Z2C4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mtmr1Q9Z2C4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mtmr1Q9Z2C4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mtmr1Q9Z2C4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mtmr1Q9Z2C4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mtmr1Q9Z2C4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Mtmr1Q9Z2C4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mtmr1Q9Z2C4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mtmr1Q9Z2C4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mtmr1Q9Z2C4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mtmr1Q9Z2C4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mtmr1Q9Z2C4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mtmr1Q9Z2C4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mtmr1Q9Z2C4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mtmr1Q9Z2C4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mtmr1Q9Z2C4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mtmr1Q9Z2C4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Mtmr1Q9Z2C4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mtmr1Q9Z2C4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mtmr1Q9Z2C4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mtmr1Q9Z2C4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mtmr1Q9Z2C4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mtmr1Q9Z2C4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Mtmr1Q9Z2C4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Mtmr1Q9Z2C4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mtmr1Q9Z2C4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mtmr1Q9Z2C4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mtmr1Q9Z2C4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mtmr1Q9Z2C4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Mtmr1Q9Z2C4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mtmr1Q9Z2C4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mtmr1Q9Z2C4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Mtmr1Q9Z2C4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mtmr1Q9Z2C4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mtmr1Q9Z2C4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mtmr1Q9Z2C4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mtmr1Q9Z2C4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mtmr1Q9Z2C4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mtmr1Q9Z2C4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Mtmr1Q9Z2C4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Mtmr1Q9Z2C4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mtmr1Q9Z2C4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mtmr1Q9Z2C4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mtmr1Q9Z2C4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mtmr1Q9Z2C4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Mtmr1Q9Z2C4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mtmr1Q9Z2C4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mtmr1Q9Z2C4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mtmr1Q9Z2C4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mtmr1Q9Z2C4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mtmr1Q9Z2C4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mtmr1Q9Z2C4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mtmr1Q9Z2C4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Mtmr1Q9Z2C4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mtmr1Q9Z2C4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mtmr1Q9Z2C4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mtmr1Q9Z2C4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mtmr1Q9Z2C4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mtmr1Q9Z2C4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mtmr1Q9Z2C4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mtmr1Q9Z2C4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mtmr1Q9Z2C4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mtmr1Q9Z2C4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mtmr1Q9Z2C4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mtmr1Q9Z2C4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mtmr1Q9Z2C4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mtmr1Q9Z2C4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mtmr1Q9Z2C4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mtmr1Q9Z2C4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mtmr1Q9Z2C4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mtmr1Q9Z2C4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mtmr1Q9Z2C4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mtmr1Q9Z2C4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mtmr1Q9Z2C4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mtmr1Q9Z2C4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mtmr1Q9Z2C4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mtmr1Q9Z2C4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mtmr1Q9Z2C4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mtmr1Q9Z2C4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mtmr1Q9Z2C4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mtmr1Q9Z2C4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mtmr1Q9Z2C4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mtmr1Q9Z2C4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mtmr1Q9Z2C4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mtmr1Q9Z2C4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mtmr1Q9Z2C4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mtmr1Q9Z2C4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mtmr1Q9Z2C4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mtmr1Q9Z2C4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mtmr1Q9Z2C4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mtmr1Q9Z2C4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mtmr1Q9Z2C4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mtmr1Q9Z2C4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mtmr1Q9Z2C4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mtmr1Q9Z2C4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mtmr1Q9Z2C4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mtmr1Q9Z2C4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mtmr1Q9Z2C4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms