Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NfkbiaQ9Z1E3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NfkbiaQ9Z1E3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NfkbiaQ9Z1E3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NfkbiaQ9Z1E3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NfkbiaQ9Z1E3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NfkbiaQ9Z1E3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NfkbiaQ9Z1E3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NfkbiaQ9Z1E3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NfkbiaQ9Z1E3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NfkbiaQ9Z1E3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NfkbiaQ9Z1E3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NfkbiaQ9Z1E3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NfkbiaQ9Z1E3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NfkbiaQ9Z1E3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NfkbiaQ9Z1E3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NfkbiaQ9Z1E3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NfkbiaQ9Z1E3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NfkbiaQ9Z1E3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NfkbiaQ9Z1E3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NfkbiaQ9Z1E3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NfkbiaQ9Z1E3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NfkbiaQ9Z1E3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NfkbiaQ9Z1E3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NfkbiaQ9Z1E3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NfkbiaQ9Z1E3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NfkbiaQ9Z1E3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NfkbiaQ9Z1E3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NfkbiaQ9Z1E3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NfkbiaQ9Z1E3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NfkbiaQ9Z1E3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NfkbiaQ9Z1E3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NfkbiaQ9Z1E3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NfkbiaQ9Z1E3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NfkbiaQ9Z1E3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NfkbiaQ9Z1E3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NfkbiaQ9Z1E3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NfkbiaQ9Z1E3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NfkbiaQ9Z1E3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NfkbiaQ9Z1E3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NfkbiaQ9Z1E3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NfkbiaQ9Z1E3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NfkbiaQ9Z1E3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NfkbiaQ9Z1E3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NfkbiaQ9Z1E3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NfkbiaQ9Z1E3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NfkbiaQ9Z1E3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NfkbiaQ9Z1E3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NfkbiaQ9Z1E3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NfkbiaQ9Z1E3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NfkbiaQ9Z1E3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NfkbiaQ9Z1E3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NfkbiaQ9Z1E3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NfkbiaQ9Z1E3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NfkbiaQ9Z1E3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NfkbiaQ9Z1E3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NfkbiaQ9Z1E3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NfkbiaQ9Z1E3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NfkbiaQ9Z1E3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NfkbiaQ9Z1E3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NfkbiaQ9Z1E3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NfkbiaQ9Z1E3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NfkbiaQ9Z1E3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NfkbiaQ9Z1E3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NfkbiaQ9Z1E3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NfkbiaQ9Z1E3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NfkbiaQ9Z1E3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NfkbiaQ9Z1E3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NfkbiaQ9Z1E3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NfkbiaQ9Z1E3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NfkbiaQ9Z1E3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NfkbiaQ9Z1E3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NfkbiaQ9Z1E3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NfkbiaQ9Z1E3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NfkbiaQ9Z1E3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NfkbiaQ9Z1E3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NfkbiaQ9Z1E3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NfkbiaQ9Z1E3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NfkbiaQ9Z1E3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NfkbiaQ9Z1E3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NfkbiaQ9Z1E3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NfkbiaQ9Z1E3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NfkbiaQ9Z1E3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NfkbiaQ9Z1E3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NfkbiaQ9Z1E3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NfkbiaQ9Z1E3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NfkbiaQ9Z1E3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NfkbiaQ9Z1E3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NfkbiaQ9Z1E3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NfkbiaQ9Z1E3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NfkbiaQ9Z1E3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NfkbiaQ9Z1E3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NfkbiaQ9Z1E3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NfkbiaQ9Z1E3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms