Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itgb6Q9Z0T9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itgb6Q9Z0T9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itgb6Q9Z0T9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itgb6Q9Z0T9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itgb6Q9Z0T9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itgb6Q9Z0T9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb6Q9Z0T9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb6Q9Z0T9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb6Q9Z0T9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb6Q9Z0T9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb6Q9Z0T9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb6Q9Z0T9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb6Q9Z0T9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb6Q9Z0T9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb6Q9Z0T9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb6Q9Z0T9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb6Q9Z0T9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb6Q9Z0T9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb6Q9Z0T9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itgb6Q9Z0T9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itgb6Q9Z0T9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itgb6Q9Z0T9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itgb6Q9Z0T9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itgb6Q9Z0T9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Itgb6Q9Z0T9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb6Q9Z0T9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb6Q9Z0T9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb6Q9Z0T9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb6Q9Z0T9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb6Q9Z0T9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb6Q9Z0T9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb6Q9Z0T9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb6Q9Z0T9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb6Q9Z0T9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb6Q9Z0T9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb6Q9Z0T9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb6Q9Z0T9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb6Q9Z0T9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb6Q9Z0T9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb6Q9Z0T9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb6Q9Z0T9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb6Q9Z0T9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb6Q9Z0T9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb6Q9Z0T9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms