Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6B7

AP4B1, AP-4 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4B1Q9Y6B7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP4B1Q9Y6B7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP4B1Q9Y6B7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP4B1Q9Y6B7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP4B1Q9Y6B7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP4B1Q9Y6B7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP4B1Q9Y6B7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP4B1Q9Y6B7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP4B1Q9Y6B7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP4B1Q9Y6B7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP4B1Q9Y6B7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP4B1Q9Y6B7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP4B1Q9Y6B7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP4B1Q9Y6B7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP4B1Q9Y6B7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP4B1Q9Y6B7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP4B1Q9Y6B7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP4B1Q9Y6B7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP4B1Q9Y6B7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AP4B1Q9Y6B7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP4B1Q9Y6B7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP4B1Q9Y6B7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP4B1Q9Y6B7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP4B1Q9Y6B7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP4B1Q9Y6B7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP4B1Q9Y6B7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP4B1Q9Y6B7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
AP4B1Q9Y6B7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP4B1Q9Y6B7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP4B1Q9Y6B7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP4B1Q9Y6B7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms