Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X3

SNX5, Sorting nexin-5, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX5Q9Y5X3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SNX5Q9Y5X3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX5Q9Y5X3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX5Q9Y5X3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX5Q9Y5X3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX5Q9Y5X3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX5Q9Y5X3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX5Q9Y5X3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX5Q9Y5X3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX5Q9Y5X3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX5Q9Y5X3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX5Q9Y5X3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX5Q9Y5X3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX5Q9Y5X3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX5Q9Y5X3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX5Q9Y5X3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX5Q9Y5X3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX5Q9Y5X3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX5Q9Y5X3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX5Q9Y5X3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX5Q9Y5X3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX5Q9Y5X3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX5Q9Y5X3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX5Q9Y5X3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX5Q9Y5X3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX5Q9Y5X3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX5Q9Y5X3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX5Q9Y5X3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX5Q9Y5X3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX5Q9Y5X3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX5Q9Y5X3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX5Q9Y5X3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX5Q9Y5X3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX5Q9Y5X3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX5Q9Y5X3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX5Q9Y5X3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX5Q9Y5X3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX5Q9Y5X3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX5Q9Y5X3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX5Q9Y5X3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX5Q9Y5X3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX5Q9Y5X3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX5Q9Y5X3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX5Q9Y5X3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX5Q9Y5X3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX5Q9Y5X3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX5Q9Y5X3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX5Q9Y5X3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX5Q9Y5X3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX5Q9Y5X3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX5Q9Y5X3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX5Q9Y5X3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms