Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E5

PCDHB4, Protocadherin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB4Q9Y5E5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHB4Q9Y5E5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHB4Q9Y5E5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHB4Q9Y5E5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHB4Q9Y5E5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHB4Q9Y5E5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHB4Q9Y5E5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHB4Q9Y5E5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHB4Q9Y5E5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHB4Q9Y5E5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHB4Q9Y5E5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHB4Q9Y5E5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHB4Q9Y5E5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHB4Q9Y5E5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHB4Q9Y5E5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHB4Q9Y5E5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHB4Q9Y5E5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHB4Q9Y5E5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHB4Q9Y5E5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHB4Q9Y5E5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDHB4Q9Y5E5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDHB4Q9Y5E5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDHB4Q9Y5E5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDHB4Q9Y5E5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDHB4Q9Y5E5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCDHB4Q9Y5E5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCDHB4Q9Y5E5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCDHB4Q9Y5E5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCDHB4Q9Y5E5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHB4Q9Y5E5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHB4Q9Y5E5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHB4Q9Y5E5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHB4Q9Y5E5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHB4Q9Y5E5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHB4Q9Y5E5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHB4Q9Y5E5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHB4Q9Y5E5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB4Q9Y5E5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB4Q9Y5E5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB4Q9Y5E5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB4Q9Y5E5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB4Q9Y5E5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB4Q9Y5E5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB4Q9Y5E5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB4Q9Y5E5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB4Q9Y5E5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB4Q9Y5E5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB4Q9Y5E5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHB4Q9Y5E5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHB4Q9Y5E5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHB4Q9Y5E5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHB4Q9Y5E5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHB4Q9Y5E5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHB4Q9Y5E5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHB4Q9Y5E5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHB4Q9Y5E5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHB4Q9Y5E5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHB4Q9Y5E5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHB4Q9Y5E5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHB4Q9Y5E5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHB4Q9Y5E5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHB4Q9Y5E5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHB4Q9Y5E5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHB4Q9Y5E5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHB4Q9Y5E5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHB4Q9Y5E5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHB4Q9Y5E5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHB4Q9Y5E5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB4Q9Y5E5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB4Q9Y5E5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB4Q9Y5E5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB4Q9Y5E5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB4Q9Y5E5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PCDHB4Q9Y5E5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PCDHB4Q9Y5E5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PCDHB4Q9Y5E5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PCDHB4Q9Y5E5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB4Q9Y5E5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB4Q9Y5E5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB4Q9Y5E5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB4Q9Y5E5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB4Q9Y5E5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHB4Q9Y5E5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHB4Q9Y5E5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHB4Q9Y5E5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHB4Q9Y5E5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHB4Q9Y5E5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHB4Q9Y5E5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHB4Q9Y5E5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHB4Q9Y5E5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHB4Q9Y5E5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHB4Q9Y5E5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHB4Q9Y5E5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHB4Q9Y5E5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHB4Q9Y5E5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHB4Q9Y5E5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHB4Q9Y5E5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHB4Q9Y5E5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHB4Q9Y5E5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHB4Q9Y5E5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms