Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E4

PCDHB5, Protocadherin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB5Q9Y5E4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCDHB5Q9Y5E4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB5Q9Y5E4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB5Q9Y5E4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB5Q9Y5E4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHB5Q9Y5E4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHB5Q9Y5E4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHB5Q9Y5E4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHB5Q9Y5E4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHB5Q9Y5E4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHB5Q9Y5E4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHB5Q9Y5E4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHB5Q9Y5E4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHB5Q9Y5E4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHB5Q9Y5E4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHB5Q9Y5E4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHB5Q9Y5E4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHB5Q9Y5E4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHB5Q9Y5E4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHB5Q9Y5E4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHB5Q9Y5E4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHB5Q9Y5E4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHB5Q9Y5E4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHB5Q9Y5E4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHB5Q9Y5E4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHB5Q9Y5E4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHB5Q9Y5E4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHB5Q9Y5E4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHB5Q9Y5E4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHB5Q9Y5E4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHB5Q9Y5E4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHB5Q9Y5E4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHB5Q9Y5E4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHB5Q9Y5E4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHB5Q9Y5E4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHB5Q9Y5E4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHB5Q9Y5E4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHB5Q9Y5E4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHB5Q9Y5E4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHB5Q9Y5E4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHB5Q9Y5E4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHB5Q9Y5E4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHB5Q9Y5E4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHB5Q9Y5E4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHB5Q9Y5E4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHB5Q9Y5E4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHB5Q9Y5E4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHB5Q9Y5E4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHB5Q9Y5E4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHB5Q9Y5E4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHB5Q9Y5E4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHB5Q9Y5E4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHB5Q9Y5E4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHB5Q9Y5E4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHB5Q9Y5E4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHB5Q9Y5E4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB5Q9Y5E4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB5Q9Y5E4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB5Q9Y5E4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB5Q9Y5E4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB5Q9Y5E4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB5Q9Y5E4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB5Q9Y5E4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHB5Q9Y5E4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHB5Q9Y5E4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHB5Q9Y5E4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHB5Q9Y5E4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHB5Q9Y5E4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHB5Q9Y5E4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHB5Q9Y5E4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHB5Q9Y5E4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHB5Q9Y5E4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHB5Q9Y5E4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHB5Q9Y5E4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHB5Q9Y5E4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHB5Q9Y5E4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHB5Q9Y5E4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHB5Q9Y5E4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHB5Q9Y5E4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHB5Q9Y5E4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHB5Q9Y5E4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHB5Q9Y5E4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHB5Q9Y5E4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHB5Q9Y5E4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHB5Q9Y5E4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms