Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y546

LRRC42, Leucine-rich repeat-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC42Q9Y546 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC42Q9Y546 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC42Q9Y546 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC42Q9Y546 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC42Q9Y546 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC42Q9Y546 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC42Q9Y546 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC42Q9Y546 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC42Q9Y546 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC42Q9Y546 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC42Q9Y546 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC42Q9Y546 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC42Q9Y546 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC42Q9Y546 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC42Q9Y546 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC42Q9Y546 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC42Q9Y546 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC42Q9Y546 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC42Q9Y546 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC42Q9Y546 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC42Q9Y546 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC42Q9Y546 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC42Q9Y546 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC42Q9Y546 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC42Q9Y546 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC42Q9Y546 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC42Q9Y546 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC42Q9Y546 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC42Q9Y546 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC42Q9Y546 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC42Q9Y546 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC42Q9Y546 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC42Q9Y546 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC42Q9Y546 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC42Q9Y546 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC42Q9Y546 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC42Q9Y546 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC42Q9Y546 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC42Q9Y546 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC42Q9Y546 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC42Q9Y546 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC42Q9Y546 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC42Q9Y546 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC42Q9Y546 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC42Q9Y546 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC42Q9Y546 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC42Q9Y546 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC42Q9Y546 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC42Q9Y546 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC42Q9Y546 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC42Q9Y546 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC42Q9Y546 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC42Q9Y546 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC42Q9Y546 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC42Q9Y546 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC42Q9Y546 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC42Q9Y546 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC42Q9Y546 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC42Q9Y546 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC42Q9Y546 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC42Q9Y546 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC42Q9Y546 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC42Q9Y546 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC42Q9Y546 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC42Q9Y546 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC42Q9Y546 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC42Q9Y546 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC42Q9Y546 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC42Q9Y546 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC42Q9Y546 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC42Q9Y546 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC42Q9Y546 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC42Q9Y546 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC42Q9Y546 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC42Q9Y546 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC42Q9Y546 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC42Q9Y546 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC42Q9Y546 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC42Q9Y546 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC42Q9Y546 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC42Q9Y546 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC42Q9Y546 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC42Q9Y546 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC42Q9Y546 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC42Q9Y546 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC42Q9Y546 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC42Q9Y546 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC42Q9Y546 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC42Q9Y546 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC42Q9Y546 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC42Q9Y546 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC42Q9Y546 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC42Q9Y546 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC42Q9Y546 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC42Q9Y546 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC42Q9Y546 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC42Q9Y546 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC42Q9Y546 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC42Q9Y546 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC42Q9Y546 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms