Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Lemd3Q9WU40 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Lemd3Q9WU40 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Lemd3Q9WU40 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Lemd3Q9WU40 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Lemd3Q9WU40 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Lemd3Q9WU40 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Lemd3Q9WU40 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Lemd3Q9WU40 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Lemd3Q9WU40 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Lemd3Q9WU40 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Lemd3Q9WU40 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Lemd3Q9WU40 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Lemd3Q9WU40 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Lemd3Q9WU40 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Lemd3Q9WU40 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Lemd3Q9WU40 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Lemd3Q9WU40 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Lemd3Q9WU40 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Lemd3Q9WU40 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Lemd3Q9WU40 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Lemd3Q9WU40 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Lemd3Q9WU40 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Lemd3Q9WU40 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Lemd3Q9WU40 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Lemd3Q9WU40 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Lemd3Q9WU40 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Lemd3Q9WU40 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Lemd3Q9WU40 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Lemd3Q9WU40 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Lemd3Q9WU40 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Lemd3Q9WU40 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Lemd3Q9WU40 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Lemd3Q9WU40 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Lemd3Q9WU40 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Lemd3Q9WU40 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Lemd3Q9WU40 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Lemd3Q9WU40 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Lemd3Q9WU40 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Lemd3Q9WU40 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Lemd3Q9WU40 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Lemd3Q9WU40 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Lemd3Q9WU40 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Lemd3Q9WU40 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.73
Lemd3Q9WU40 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Lemd3Q9WU40 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Lemd3Q9WU40 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Lemd3Q9WU40 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Lemd3Q9WU40 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Lemd3Q9WU40 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Lemd3Q9WU40 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Lemd3Q9WU40 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Lemd3Q9WU40 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Lemd3Q9WU40 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Lemd3Q9WU40 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Lemd3Q9WU40 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Lemd3Q9WU40 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Lemd3Q9WU40 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Lemd3Q9WU40 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Lemd3Q9WU40 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Lemd3Q9WU40 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Lemd3Q9WU40 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Lemd3Q9WU40 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Lemd3Q9WU40 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Lemd3Q9WU40 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Lemd3Q9WU40 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Lemd3Q9WU40 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Lemd3Q9WU40 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Lemd3Q9WU40 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Lemd3Q9WU40 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Lemd3Q9WU40 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Lemd3Q9WU40 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Lemd3Q9WU40 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Lemd3Q9WU40 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Lemd3Q9WU40 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Lemd3Q9WU40 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Lemd3Q9WU40 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Lemd3Q9WU40 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Lemd3Q9WU40 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Lemd3Q9WU40 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Lemd3Q9WU40 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Lemd3Q9WU40 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Lemd3Q9WU40 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Lemd3Q9WU40 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Lemd3Q9WU40 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Lemd3Q9WU40 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Lemd3Q9WU40 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Lemd3Q9WU40 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Lemd3Q9WU40 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Lemd3Q9WU40 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Lemd3Q9WU40 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Lemd3Q9WU40 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Lemd3Q9WU40 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Lemd3Q9WU40 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Lemd3Q9WU40 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Lemd3Q9WU40 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Lemd3Q9WU40 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Lemd3Q9WU40 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Lemd3Q9WU40 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Lemd3Q9WU40 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms