Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkraQ9WTX2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkraQ9WTX2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkraQ9WTX2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkraQ9WTX2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkraQ9WTX2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkraQ9WTX2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkraQ9WTX2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkraQ9WTX2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkraQ9WTX2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkraQ9WTX2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkraQ9WTX2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkraQ9WTX2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkraQ9WTX2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkraQ9WTX2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkraQ9WTX2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkraQ9WTX2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkraQ9WTX2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkraQ9WTX2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkraQ9WTX2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkraQ9WTX2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkraQ9WTX2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkraQ9WTX2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkraQ9WTX2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.83
PrkraQ9WTX2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkraQ9WTX2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkraQ9WTX2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkraQ9WTX2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkraQ9WTX2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkraQ9WTX2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkraQ9WTX2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkraQ9WTX2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkraQ9WTX2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkraQ9WTX2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkraQ9WTX2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkraQ9WTX2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkraQ9WTX2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkraQ9WTX2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkraQ9WTX2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkraQ9WTX2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkraQ9WTX2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkraQ9WTX2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkraQ9WTX2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkraQ9WTX2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkraQ9WTX2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkraQ9WTX2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkraQ9WTX2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkraQ9WTX2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkraQ9WTX2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkraQ9WTX2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkraQ9WTX2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkraQ9WTX2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkraQ9WTX2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkraQ9WTX2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkraQ9WTX2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkraQ9WTX2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkraQ9WTX2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkraQ9WTX2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkraQ9WTX2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkraQ9WTX2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkraQ9WTX2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkraQ9WTX2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkraQ9WTX2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkraQ9WTX2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkraQ9WTX2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkraQ9WTX2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkraQ9WTX2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkraQ9WTX2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkraQ9WTX2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkraQ9WTX2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkraQ9WTX2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkraQ9WTX2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkraQ9WTX2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkraQ9WTX2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkraQ9WTX2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkraQ9WTX2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkraQ9WTX2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkraQ9WTX2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkraQ9WTX2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkraQ9WTX2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkraQ9WTX2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkraQ9WTX2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkraQ9WTX2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkraQ9WTX2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkraQ9WTX2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkraQ9WTX2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkraQ9WTX2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkraQ9WTX2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkraQ9WTX2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkraQ9WTX2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkraQ9WTX2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkraQ9WTX2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkraQ9WTX2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkraQ9WTX2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkraQ9WTX2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkraQ9WTX2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkraQ9WTX2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkraQ9WTX2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkraQ9WTX2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkraQ9WTX2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms