Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HPS5Q9UPZ3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HPS5Q9UPZ3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HPS5Q9UPZ3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HPS5Q9UPZ3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HPS5Q9UPZ3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
HPS5Q9UPZ3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HPS5Q9UPZ3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HPS5Q9UPZ3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HPS5Q9UPZ3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HPS5Q9UPZ3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HPS5Q9UPZ3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HPS5Q9UPZ3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HPS5Q9UPZ3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HPS5Q9UPZ3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HPS5Q9UPZ3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HPS5Q9UPZ3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
HPS5Q9UPZ3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
HPS5Q9UPZ3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
HPS5Q9UPZ3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HPS5Q9UPZ3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HPS5Q9UPZ3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HPS5Q9UPZ3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HPS5Q9UPZ3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HPS5Q9UPZ3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HPS5Q9UPZ3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HPS5Q9UPZ3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HPS5Q9UPZ3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HPS5Q9UPZ3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HPS5Q9UPZ3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HPS5Q9UPZ3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HPS5Q9UPZ3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HPS5Q9UPZ3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HPS5Q9UPZ3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HPS5Q9UPZ3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HPS5Q9UPZ3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HPS5Q9UPZ3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HPS5Q9UPZ3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HPS5Q9UPZ3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HPS5Q9UPZ3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HPS5Q9UPZ3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HPS5Q9UPZ3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HPS5Q9UPZ3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HPS5Q9UPZ3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
HPS5Q9UPZ3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HPS5Q9UPZ3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HPS5Q9UPZ3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HPS5Q9UPZ3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
HPS5Q9UPZ3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HPS5Q9UPZ3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HPS5Q9UPZ3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HPS5Q9UPZ3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
HPS5Q9UPZ3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HPS5Q9UPZ3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HPS5Q9UPZ3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
HPS5Q9UPZ3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HPS5Q9UPZ3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HPS5Q9UPZ3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HPS5Q9UPZ3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HPS5Q9UPZ3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HPS5Q9UPZ3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
HPS5Q9UPZ3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HPS5Q9UPZ3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
HPS5Q9UPZ3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
HPS5Q9UPZ3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HPS5Q9UPZ3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HPS5Q9UPZ3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HPS5Q9UPZ3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HPS5Q9UPZ3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HPS5Q9UPZ3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HPS5Q9UPZ3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HPS5Q9UPZ3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HPS5Q9UPZ3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
HPS5Q9UPZ3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HPS5Q9UPZ3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HPS5Q9UPZ3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HPS5Q9UPZ3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HPS5Q9UPZ3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HPS5Q9UPZ3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HPS5Q9UPZ3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HPS5Q9UPZ3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HPS5Q9UPZ3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HPS5Q9UPZ3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
HPS5Q9UPZ3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HPS5Q9UPZ3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HPS5Q9UPZ3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HPS5Q9UPZ3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HPS5Q9UPZ3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HPS5Q9UPZ3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HPS5Q9UPZ3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HPS5Q9UPZ3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HPS5Q9UPZ3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HPS5Q9UPZ3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HPS5Q9UPZ3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
HPS5Q9UPZ3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HPS5Q9UPZ3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HPS5Q9UPZ3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HPS5Q9UPZ3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HPS5Q9UPZ3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HPS5Q9UPZ3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms