Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV0

CEP164, Centrosomal protein of 164 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP164Q9UPV0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
CEP164Q9UPV0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
CEP164Q9UPV0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
CEP164Q9UPV0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
CEP164Q9UPV0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
CEP164Q9UPV0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
CEP164Q9UPV0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC41.41■■■■■ 4.22
CEP164Q9UPV0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
CEP164Q9UPV0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
CEP164Q9UPV0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
CEP164Q9UPV0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
CEP164Q9UPV0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
CEP164Q9UPV0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
CEP164Q9UPV0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
CEP164Q9UPV0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
CEP164Q9UPV0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
CEP164Q9UPV0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC41.38■■■■■ 4.21
CEP164Q9UPV0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
CEP164Q9UPV0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC41.36■■■■■ 4.21
CEP164Q9UPV0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
CEP164Q9UPV0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
CEP164Q9UPV0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
CEP164Q9UPV0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC41.34■■■■■ 4.21
CEP164Q9UPV0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
CEP164Q9UPV0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
CEP164Q9UPV0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
CEP164Q9UPV0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
CEP164Q9UPV0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
CEP164Q9UPV0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.33■■■■■ 4.21
CEP164Q9UPV0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
CEP164Q9UPV0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.21
CEP164Q9UPV0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
CEP164Q9UPV0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
CEP164Q9UPV0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
CEP164Q9UPV0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
CEP164Q9UPV0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.2
CEP164Q9UPV0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
CEP164Q9UPV0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.2
CEP164Q9UPV0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.2
CEP164Q9UPV0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.2
CEP164Q9UPV0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC41.32■■■■■ 4.2
CEP164Q9UPV0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.2
CEP164Q9UPV0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.2
CEP164Q9UPV0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
CEP164Q9UPV0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
CEP164Q9UPV0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
CEP164Q9UPV0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
CEP164Q9UPV0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
CEP164Q9UPV0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
CEP164Q9UPV0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
CEP164Q9UPV0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
CEP164Q9UPV0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
CEP164Q9UPV0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
CEP164Q9UPV0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
CEP164Q9UPV0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC41.28■■■■■ 4.2
CEP164Q9UPV0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
CEP164Q9UPV0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
CEP164Q9UPV0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC41.27■■■■■ 4.2
CEP164Q9UPV0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
CEP164Q9UPV0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
CEP164Q9UPV0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.26■■■■■ 4.2
CEP164Q9UPV0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
CEP164Q9UPV0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
CEP164Q9UPV0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC41.25■■■■■ 4.19
CEP164Q9UPV0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
CEP164Q9UPV0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC41.24■■■■■ 4.19
CEP164Q9UPV0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC41.24■■■■■ 4.19
CEP164Q9UPV0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.24■■■■■ 4.19
CEP164Q9UPV0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
CEP164Q9UPV0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC41.24■■■■■ 4.19
CEP164Q9UPV0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
CEP164Q9UPV0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
CEP164Q9UPV0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC41.22■■■■■ 4.19
CEP164Q9UPV0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
CEP164Q9UPV0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
CEP164Q9UPV0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
CEP164Q9UPV0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
CEP164Q9UPV0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
CEP164Q9UPV0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
CEP164Q9UPV0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC41.2■■■■■ 4.19
CEP164Q9UPV0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
CEP164Q9UPV0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
CEP164Q9UPV0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
CEP164Q9UPV0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC41.19■■■■■ 4.19
CEP164Q9UPV0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
CEP164Q9UPV0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
CEP164Q9UPV0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
CEP164Q9UPV0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC41.18■■■■■ 4.18
CEP164Q9UPV0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
CEP164Q9UPV0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
CEP164Q9UPV0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
CEP164Q9UPV0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
CEP164Q9UPV0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC41.17■■■■■ 4.18
CEP164Q9UPV0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
CEP164Q9UPV0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
CEP164Q9UPV0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
CEP164Q9UPV0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
CEP164Q9UPV0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC41.16■■■■■ 4.18
CEP164Q9UPV0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
CEP164Q9UPV0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms