Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SORCS3Q9UPU3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SORCS3Q9UPU3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SORCS3Q9UPU3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SORCS3Q9UPU3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SORCS3Q9UPU3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SORCS3Q9UPU3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SORCS3Q9UPU3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SORCS3Q9UPU3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SORCS3Q9UPU3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SORCS3Q9UPU3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SORCS3Q9UPU3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SORCS3Q9UPU3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SORCS3Q9UPU3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SORCS3Q9UPU3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SORCS3Q9UPU3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SORCS3Q9UPU3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SORCS3Q9UPU3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SORCS3Q9UPU3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SORCS3Q9UPU3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SORCS3Q9UPU3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SORCS3Q9UPU3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SORCS3Q9UPU3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SORCS3Q9UPU3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SORCS3Q9UPU3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SORCS3Q9UPU3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SORCS3Q9UPU3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SORCS3Q9UPU3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SORCS3Q9UPU3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SORCS3Q9UPU3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SORCS3Q9UPU3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SORCS3Q9UPU3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SORCS3Q9UPU3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SORCS3Q9UPU3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SORCS3Q9UPU3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SORCS3Q9UPU3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SORCS3Q9UPU3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SORCS3Q9UPU3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SORCS3Q9UPU3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SORCS3Q9UPU3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SORCS3Q9UPU3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SORCS3Q9UPU3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SORCS3Q9UPU3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SORCS3Q9UPU3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SORCS3Q9UPU3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SORCS3Q9UPU3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SORCS3Q9UPU3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SORCS3Q9UPU3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SORCS3Q9UPU3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SORCS3Q9UPU3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SORCS3Q9UPU3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SORCS3Q9UPU3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SORCS3Q9UPU3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SORCS3Q9UPU3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SORCS3Q9UPU3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SORCS3Q9UPU3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SORCS3Q9UPU3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SORCS3Q9UPU3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SORCS3Q9UPU3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SORCS3Q9UPU3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SORCS3Q9UPU3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SORCS3Q9UPU3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SORCS3Q9UPU3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SORCS3Q9UPU3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SORCS3Q9UPU3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SORCS3Q9UPU3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SORCS3Q9UPU3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SORCS3Q9UPU3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SORCS3Q9UPU3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SORCS3Q9UPU3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SORCS3Q9UPU3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SORCS3Q9UPU3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SORCS3Q9UPU3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SORCS3Q9UPU3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SORCS3Q9UPU3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SORCS3Q9UPU3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SORCS3Q9UPU3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SORCS3Q9UPU3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SORCS3Q9UPU3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SORCS3Q9UPU3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SORCS3Q9UPU3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SORCS3Q9UPU3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SORCS3Q9UPU3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SORCS3Q9UPU3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SORCS3Q9UPU3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SORCS3Q9UPU3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SORCS3Q9UPU3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SORCS3Q9UPU3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SORCS3Q9UPU3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SORCS3Q9UPU3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SORCS3Q9UPU3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SORCS3Q9UPU3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SORCS3Q9UPU3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SORCS3Q9UPU3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SORCS3Q9UPU3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SORCS3Q9UPU3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SORCS3Q9UPU3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SORCS3Q9UPU3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SORCS3Q9UPU3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SORCS3Q9UPU3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms