Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW3

ABT1, Activator of basal transcription 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABT1Q9ULW3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ABT1Q9ULW3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ABT1Q9ULW3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABT1Q9ULW3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABT1Q9ULW3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABT1Q9ULW3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABT1Q9ULW3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ABT1Q9ULW3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABT1Q9ULW3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABT1Q9ULW3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABT1Q9ULW3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABT1Q9ULW3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABT1Q9ULW3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABT1Q9ULW3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABT1Q9ULW3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABT1Q9ULW3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABT1Q9ULW3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABT1Q9ULW3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABT1Q9ULW3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABT1Q9ULW3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABT1Q9ULW3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABT1Q9ULW3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ABT1Q9ULW3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ABT1Q9ULW3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABT1Q9ULW3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABT1Q9ULW3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABT1Q9ULW3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABT1Q9ULW3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABT1Q9ULW3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABT1Q9ULW3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABT1Q9ULW3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ABT1Q9ULW3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
ABT1Q9ULW3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABT1Q9ULW3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABT1Q9ULW3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ABT1Q9ULW3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABT1Q9ULW3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABT1Q9ULW3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABT1Q9ULW3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABT1Q9ULW3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ABT1Q9ULW3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABT1Q9ULW3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABT1Q9ULW3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABT1Q9ULW3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABT1Q9ULW3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABT1Q9ULW3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABT1Q9ULW3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ABT1Q9ULW3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABT1Q9ULW3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABT1Q9ULW3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABT1Q9ULW3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABT1Q9ULW3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABT1Q9ULW3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABT1Q9ULW3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABT1Q9ULW3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ABT1Q9ULW3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABT1Q9ULW3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABT1Q9ULW3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABT1Q9ULW3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ABT1Q9ULW3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABT1Q9ULW3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABT1Q9ULW3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABT1Q9ULW3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABT1Q9ULW3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABT1Q9ULW3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABT1Q9ULW3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ABT1Q9ULW3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABT1Q9ULW3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABT1Q9ULW3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABT1Q9ULW3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABT1Q9ULW3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABT1Q9ULW3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABT1Q9ULW3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABT1Q9ULW3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABT1Q9ULW3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABT1Q9ULW3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABT1Q9ULW3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABT1Q9ULW3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABT1Q9ULW3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABT1Q9ULW3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABT1Q9ULW3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABT1Q9ULW3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABT1Q9ULW3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABT1Q9ULW3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABT1Q9ULW3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABT1Q9ULW3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABT1Q9ULW3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABT1Q9ULW3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ABT1Q9ULW3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABT1Q9ULW3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABT1Q9ULW3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABT1Q9ULW3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABT1Q9ULW3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABT1Q9ULW3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABT1Q9ULW3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABT1Q9ULW3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABT1Q9ULW3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABT1Q9ULW3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABT1Q9ULW3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABT1Q9ULW3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms