Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF346Q9UL40 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF346Q9UL40 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF346Q9UL40 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF346Q9UL40 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF346Q9UL40 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF346Q9UL40 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF346Q9UL40 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF346Q9UL40 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF346Q9UL40 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF346Q9UL40 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF346Q9UL40 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF346Q9UL40 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF346Q9UL40 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF346Q9UL40 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF346Q9UL40 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF346Q9UL40 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF346Q9UL40 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF346Q9UL40 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF346Q9UL40 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF346Q9UL40 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF346Q9UL40 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF346Q9UL40 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF346Q9UL40 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZNF346Q9UL40 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF346Q9UL40 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF346Q9UL40 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF346Q9UL40 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF346Q9UL40 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF346Q9UL40 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF346Q9UL40 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF346Q9UL40 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF346Q9UL40 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF346Q9UL40 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF346Q9UL40 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF346Q9UL40 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF346Q9UL40 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF346Q9UL40 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF346Q9UL40 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF346Q9UL40 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF346Q9UL40 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF346Q9UL40 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF346Q9UL40 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF346Q9UL40 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF346Q9UL40 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF346Q9UL40 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF346Q9UL40 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF346Q9UL40 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF346Q9UL40 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF346Q9UL40 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF346Q9UL40 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF346Q9UL40 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF346Q9UL40 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF346Q9UL40 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF346Q9UL40 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF346Q9UL40 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF346Q9UL40 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF346Q9UL40 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF346Q9UL40 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF346Q9UL40 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF346Q9UL40 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF346Q9UL40 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF346Q9UL40 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF346Q9UL40 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF346Q9UL40 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF346Q9UL40 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF346Q9UL40 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF346Q9UL40 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF346Q9UL40 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF346Q9UL40 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF346Q9UL40 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF346Q9UL40 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF346Q9UL40 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF346Q9UL40 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF346Q9UL40 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ZNF346Q9UL40 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF346Q9UL40 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF346Q9UL40 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF346Q9UL40 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF346Q9UL40 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF346Q9UL40 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF346Q9UL40 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF346Q9UL40 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF346Q9UL40 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF346Q9UL40 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF346Q9UL40 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF346Q9UL40 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF346Q9UL40 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF346Q9UL40 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF346Q9UL40 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF346Q9UL40 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF346Q9UL40 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF346Q9UL40 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF346Q9UL40 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF346Q9UL40 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF346Q9UL40 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF346Q9UL40 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF346Q9UL40 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF346Q9UL40 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF346Q9UL40 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162 ms