Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ1

CNOT11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT11Q9UKZ1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT11Q9UKZ1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT11Q9UKZ1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT11Q9UKZ1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT11Q9UKZ1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT11Q9UKZ1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT11Q9UKZ1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT11Q9UKZ1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT11Q9UKZ1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT11Q9UKZ1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT11Q9UKZ1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT11Q9UKZ1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT11Q9UKZ1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT11Q9UKZ1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT11Q9UKZ1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT11Q9UKZ1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT11Q9UKZ1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT11Q9UKZ1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNOT11Q9UKZ1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNOT11Q9UKZ1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT11Q9UKZ1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT11Q9UKZ1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT11Q9UKZ1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT11Q9UKZ1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT11Q9UKZ1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT11Q9UKZ1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT11Q9UKZ1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT11Q9UKZ1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT11Q9UKZ1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT11Q9UKZ1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT11Q9UKZ1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT11Q9UKZ1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT11Q9UKZ1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT11Q9UKZ1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT11Q9UKZ1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT11Q9UKZ1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT11Q9UKZ1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT11Q9UKZ1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT11Q9UKZ1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT11Q9UKZ1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT11Q9UKZ1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT11Q9UKZ1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT11Q9UKZ1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT11Q9UKZ1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT11Q9UKZ1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT11Q9UKZ1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms